基本情報

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麻生 啓文(アソウ ヒロフミ)

ASO Hirofumi


職名

助教

ホームページ

https://shimizuhideyuki-lab.org

研究分野・キーワード

感染症、バイオインフォマティクス

分野紹介URL

国立・東京医科歯科大学AIシステム医科学分野【清水研】

出身学校 【 表示 / 非表示

  • 京都大学  薬学部  薬科学科  2018年03月  卒業

出身大学院 【 表示 / 非表示

  • 京都大学  薬学研究科  薬科学専攻  博士課程  2023年03月  修了

  • 京都大学  薬学研究科  薬科学専攻  修士課程  2020年03月  修了

取得学位 【 表示 / 非表示

  • 博士 (薬科学)  京都大学

  • 修士 (薬科学)  京都大学

  • 学士 (薬科学)  京都大学

経歴(学内) 【 表示 / 非表示

  • 2023年04月
    -
    2024年03月
    東京医科歯科大学 M&Dデータ科学センター ヘルスインテリジェンス部門 AI システム医科学分野 特任助教
  • 2024年04月
    -
    現在
    東京医科歯科大学 M&Dデータ科学センター ヘルスインテリジェンス部門 AI システム医科学分野 助教

経歴(学外) 【 表示 / 非表示

  • 2019年04月
    -
    2023年03月
    東京大学医科学研究所 システムウイルス学分野 特別研究学生
  • 2020年04月
    -
    2023年03月
    日本学術振興会 特別研究員(DC1)

所属学協会 【 表示 / 非表示

  • 日本ウイルス学会

  • 日本分子生物学会

研究分野 【 表示 / 非表示

  • 細菌学

  • 生命、健康、医療情報学

  • ウイルス学

 

研究テーマ 【 表示 / 非表示

  • プラスミドの宿主細菌予測アルゴリズムの開発,2023年04月 - 現在

  • ウイルス感染に対する自然免疫応答の動物種間比較解析,2020年04月 - 2023年10月

  • 生体内におけるエイズウイルス感染細胞の異質性と運命決定機構の解明,2020年04月 - 2023年03月

  • ヒトiPS細胞からの生殖細胞種のin vitro再構築,2020年01月 - 2020年10月

  • HIV-1 感染標的細胞における IFN 誘導性遺伝子の発現パターンの比較解析,2018年05月 - 2019年03月

  • ネコAPOBEC3Z3タンパク質とネコ免疫不全ウイルスVifタンパク質との相互作用に関する包括的研究,2017年04月 - 2021年07月

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競争的資金等の研究課題 【 表示 / 非表示

  • プラスミドの宿主細菌予測アルゴリズムの開発

    文部科学省/日本学術振興会

論文・総説 【 表示 / 非表示

  1. Hirofumi Aso, Jumpei Ito, Haruka Ozaki, Yukie Kashima, Yutaka Suzuki, Yoshio Koyanagi, Kei Sato. Single-cell transcriptome analysis illuminating the characteristics of species-specific innate immune responses against viral infections. GigaScience. 2023.10; 12 giad086. ( PubMed, DOI )

  2. Hirofumi Aso, Shumpei Nagaoka, Eiryo Kawakami, Jumpei Ito, Saiful Islam, Benjy Jek Yang Tan, Shinji Nakaoka, Koichi Ashizaki, Katsuyuki Shiroguchi, Yutaka Suzuki, Yorifumi Satou, Yoshio Koyanagi, Kei Sato. Multiomics investigation revealing the characteristics of HIV-1-infected cells in vivo Cell Reports. 2020.07; 32 (2): 107887. ( PubMed, DOI )

  3. Hirofumi Aso, Jumpei Ito, Yoshio Koyanagi, Kei Sato. Comparative description of the expression profile of interferon-stimulated genes in multiple cell lineages targeted by HIV-1 infection Frontiers in Microbiology. 2019.03; 10 429. ( PubMed, DOI )

  4. Yusuke Kosugi, Keiya Uriu, Narumi Suzuki, Keisuke Yamamoto, Shumpei Nagaoka, Izumi Kimura, Yoriyuki Konno, Hirofumi Aso, Brian J Willett, Tomoko Kobayashi, Yoshio Koyanagi, Mahoko Takahashi Ueda, Jumpei Ito, Kei Sato. Comprehensive investigation on the interplay between feline APOBEC3Z3 proteins and feline immunodeficiency virus Vif proteins Journal of Virology. 2021.07; 95 (13): e0017821-e00178-21. ( PubMed, DOI )

  5. Yoriyuki Konno, Keiya Uriu, Takayuki Chikata, Toru Takada, Jun-Ichi Kurita, Mahoko Takahashi Ueda, Saiful Islam, Benjy Jek Yang Tan, Jumpei Ito, Hirofumi Aso, Ryuichi Kumata, Carolyn Williamson, Shingo Iwami, Masafumi Takiguchi, Yoshifumi Nishimura, Eiji Morita, Yorifumi Satou, So Nakagawa, Yoshio Koyanagi, Kei Sato. Two-step evolution of HIV-1 budding system leading to pandemic in the human population. Cell Reports. 2024.02; 43 (2): 113697. ( PubMed, DOI )

  6. Young Sun Hwang, Shinnosuke Suzuki, Yasunari Seita, Jumpei Ito, Yuka Sakata, Hirofumi Aso, Kei Sato, Brian P Hermann, Kotaro Sasaki. Reconstitution of prospermatogonial specification in vitro from human induced pluripotent stem cells Nature Communications. 2020.11; 11 (1): 5656. ( PubMed, DOI )

  7. Yusuke Nakano, Keisuke Yamamoto, Mahoko Takahashi Ueda, Andrew Soper, Yoriyuki Konno, Izumi Kimura, Keiya Uriu, Ryuichi Kumata, Hirofumi Aso, Naoko Misawa, Shumpei Nagaoka, Soma Shimizu, Keito Mitsumune, Yusuke Kosugi, Guillermo Juarez-Fernandez, Jumpei Ito, So Nakagawa, Terumasa Ikeda, Yoshio Koyanagi, Reuben S Harris, Kei Sato. A role for gorilla APOBEC3G in shaping lentivirus evolution including transmission to humans PLoS Pathogens. 2020.09; 16 (9): e1008812. ( PubMed, DOI )

  8. Yoriyuki Konno, Shumpei Nagaoka, Izumi Kimura, Keisuke Yamamoto, Yumiko Kagawa, Ryuichi Kumata, Hirofumi Aso, Mahoko Takahashi Ueda, So Nakagawa, Tomoko Kobayashi, Yoshio Koyanagi, Kei Sato. New World feline APOBEC3 potently controls inter-genus lentiviral transmission Retrovirology. 2018.04; 15 (1): 31. ( PubMed, DOI )

  9. Kei Sato, Naoko Misawa, Junko S Takeuchi, Tomoko Kobayashi, Taisuke Izumi, Hirofumi Aso, Shumpei Nagaoka, Keisuke Yamamoto, Izumi Kimura, Yoriyuki Konno, Yusuke Nakano, Yoshio Koyanagi. Experimental adaptive evolution of simian immunodeficiency virus SIVcpz to pandemic human immunodeficiency virus type 1 by using a humanized mouse model Journal of Virology. 2018.02; 92 (4): e01905-17. ( PubMed, DOI )

  10. Yusuke Nakano, Hirofumi Aso, Andrew Soper, Eri Yamada, Miyu Moriwaki, Guillermo Juarez-Fernandez, Yoshio Koyanagi, Kei Sato. A conflict of interest: the evolutionary arms race between mammalian APOBEC3 and lentiviral Vif Retrovirology. 2017.05; 14 (1): 31. ( PubMed, DOI )

  11. Andrew Soper, Guillermo Juarez-Fernandez, Hirofumi Aso, Miyu Moriwaki, Eri Yamada, Yusuke Nakano, Yoshio Koyanagi, Kei Sato. Various plus unique: Viral protein U as a plurifunctional protein for HIV-1 replication Experimental Biology and Medicine. 2017.04; 242 (8): 850-858. ( PubMed, DOI )

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書籍等出版物 【 表示 / 非表示

  1. 小嶋 将平, 渡士 幸一, 渡辺 登喜子, 堀江 真行, 麻生 啓文, 多賀 佳, 川久保 修佑, 塩野谷 果歩. 学習資料 一家に1枚 ウイルス. 文部科学省, 2023.03

  2. 佐藤 佳, 麻生 啓文, 小柳 義夫. シングルセルゲノミクス : 組織の機能, 病態が1細胞レベルで見えてきた! 第2章 シングルセル解析によるバイオロジー III. その他 17. ウイルス感染細胞の不均一性 (heterogeneity) の網羅的描出. 羊土社, 2019.12 第2章 シングルセル解析によるバイオロジー III. その他 17. ウイルス感染細胞の不均一性 (heterogeneity) の網羅的描出 (ISBN : 978-4-7581-0383-1)

講演・口頭発表等 【 表示 / 非表示

  1. 麻生啓文, 大野聡, 清水秀幸. プラスミドDNAの宿主細菌を予測するツールの開発. 第46回日本分子生物学会年会 2023.12 神戸

  2. Kohei Ota, Daisuke Koga, Hirofumi Aso, Hideyuki Shimizu. Developing a model that predicts the effectiveness of anti-cancer drug combination therapy. 第46回日本分子生物学会年会 2023.12 神戸

  3. 大谷 悠喜, 脇阪 康成, 麻生 啓文, 古賀 大介, 清水 秀幸. 微生物学を学んだ AI による次世代の感染症創薬に向けて. 第46回日本分子生物学会年会 2023.12 神戸

  4. 古賀 大介, 麻生 啓文, 大野 聡, 清水 秀幸. 機械学習を用いたゲノミクスによる2型糖尿病の病態解析. 第46回日本分子生物学会年会 2023.12 神戸

  5. Aso H, Ito J, Ozaki H, Kashima Y, Suzuki Y, Sato K. Comparative analysis of innate immune response to viral infection among animal species. EMBO Workshop Pathogen immunity and signaling 2022.04 Saint-Malo, France

  6. Kei Sato, Hirofumi Aso, Shumpei Nagaoka, Naoko Misawa, Jumpei Ito, Saiful Islam, Yutaka Suzuki, Katsuyuki Shiroguchi, Eiryo Kawakami, Yorifumi Satou, Yoshio Koyanagi. HIV持続潜伏感染に関する最先端研究 ヒト化マウスモデルにおけるHIV-1感染細胞のマルチオミクス解析. 日本エイズ学会誌 2019.11.01 熊本

  7. Sato K, Nakano Y, Yamamoto K, Ueda MT, Soper A, Kumata R, Aso H, Misawa N, Konno Y, Kimura I, Nagaoka S, Juarez-Fernandez G, Ito J, Nakagawa S, Koyanagi Y. Gorilla APOBEC3G restricts SIVcpz and influences lentiviral evolution in great ape cross-species transmissions. The 18th Awaji International Forum on Infection and Immunity 2019.09 淡路島

  8. Aso H, Ito J, Koyanagi Y, Sato K. Transcriptomic meta-analysis of interferon-stimulated genes in multiple cell lineages targeted by HIV-1 infection. The 17th International Student Seminar 2019.03 京都

  9. Konno Y, Nagaoka S, Kimura I, Yamamoto K, Kagawa Y, Kumata R, Aso H, Ueda MT, Nakagawa S, Kobayashi T, Koyanagi Y, Sato K. New World feline APOBEC3 potently controls inter-genus lentiviral transmission. 第66回日本ウイルス学会学術集会 2018.10 京都

  10. Nakano Y, Yamamoto K, Kumata R, Aso H, Soper A, Misawa N, Konno Y, Kimura I, Nagaoka S, Ikeda T, Juarez-Fernandez G, Ito J, Harris RS, Sato K, Koyanagi Y. Evolutionary journey of primate lentivirus transmission from chimpanzee to gorilla focusing on relationship between Vif and APOBEC3. Cold Spring Harbor meeting Retroviruses 2018.05 New York, USA

  11. Nakano Y, Misawa N, Kimura I, Konno Y, Nagaoka S, Yamamoto K, Aso H, Sato K, Koyanagi Y. Influence of human APOBEC3H on primate lentivirus evolution. 第65回日本ウイルス学会学術集会 2017.10 大阪

  12. 麻生啓文. テンソル分解で挑む多次元シングルセルデータマイニング. NGS EXPO 2024 2024.09 大阪

  13. 麻生啓文, 伊東潤平, 尾崎遼, 鹿島幸恵, 鈴木穣, 小柳義夫, 佐藤佳. ウイルス感染に対する動物種特異的自然免疫応答. 第17回ウイルス学キャンプ in 湯河原 2023.06 湯河原

  14. Aso H, Ito J, Ozaki H, Kashima Y, Suzuki Y, Sato K. ウイルス感染に対する自然免疫応答の動物種間比較解析. 第69回日本ウイルス学会学術集会 2022.11 長崎

  15. 佐藤 佳, 麻生 啓文, 長岡 峻平, 伊東 潤平. 最新のマルチオミクス研究と今後の展望 シングルセルトランスクリプトーム解析による生体内におけるエイズウイルス感染細胞の異質性の描出. 電気泳動 2020.11.01 オンライン

  16. Aso H, Nagaoka S, Ito J, Misawa N, Shiroguchi K, Suzuki Y, Kawakami E, Koyanagi Y, Sato K. Characterization of the heterogeneity of HIV-1-infected cells in vivo. 第67回日本ウイルス学会学術集会 2019.10 東京

  17. Nagaoka S, Aso H, Ito J, Misawa N, Islam S, Shiroguchi K, Kawakami E, Koyanagi Y, Sato K. 生体内HIV-1感染細胞のマルチオミクス解析. 日本レトロウイルス研究会夏期セミナー 2019.07 熱海

  18. Aso H, Ito J, Sato K. HIV-1感染標的細胞におけるインターフェロン誘導遺伝子発現パターンの網羅的解析. 第16回ウイルス学キャンプ in 湯河原 2019.05 湯河原

  19. 佐藤 佳, 三沢 尚子, 長岡 俊平, 麻生 啓文, 川上 英良, 中岡 慎治, 城口 克之, 佐藤 賢文, 小柳 義夫. HIV cure & reservoir HIV治癒へのオミクス解析. 日本エイズ学会誌 2018.11.01 大阪

  20. Aso H, Ito J, Koyanagi Y, Sato K. Systematic investigation of transcriptional regulations of interferon-stimulated genes. 第66回日本ウイルス学会学術集会 2018.10 京都

  21. Sato K, Konno Y, Nagaoka S, Kimura I, Aso H, Kumata R, Ito J, Koyanagi Y. システムウイルス学的アプローチからを紐解くウイルスと宿主の進化的軍拡競争のダイナミズム. 日本進化学会第20回大会 2018.08 東京

  22. Aso H, Ito J, Suzuki Y, Sato K, Koyanagi Y. HIV-1感染ヒト化マウスにおける1細胞網羅的遺伝子発現解析. 第15回ウイルス学キャンプ in 湯河原 2018.06 湯河原

  23. Nagaoka S, Kawakami E, Ito J, Misawa N, Aso H, Nakaoka S, Dou Y, Satou Y, Shiroguchi K, Koyanagi Y, Sato K. 生体内のHIV-1複製におけるエピジェネティックネットワークの解明. 第15回ウイルス学キャンプ in 湯河原 2018.06 湯河原

  24. 木村 出海, 山本 啓輔, 長岡 峻平, 麻生 啓文, 今野 順介, 中野 雄介, 佐藤 佳, 小柳 義夫. 動物レンチウイルスと宿主の進化的軍拡競争の解析 APOBEC3とVifについて. 第40回日本分子生物学会年会 2017.12.01 神戸

  25. 中野 雄介, 山本 啓輔, 熊田 隆一, 麻生 啓文, Soper Andrew, 三沢 尚子, 今野 順介, 木村 出海, 長岡 峻平, Juarez-Fernandez Guillermo, 佐藤 佳, 小柳 義夫. 種の壁としてのAPOBEC3Gとレンチウイルスの適応進化. 第40回日本分子生物学会年会 2017.12.01 神戸

  26. Aso H, Yamamoto K, Kimura I, Konno Y, Nagaoka S, Nakano Y, Sato K, Koyanagi Y. Evolutionary arms race between APOBEC3 and lentiviruses in felids. 第65回日本ウイルス学会学術集会 2017.10 大阪

  27. Nagaoka S, Yamamoto K, Aso H, Kimura I, Konno Y, Nakano Y, Sato K, Koyanagi Y. ネコ科動物由来APOBEC3とネコ免疫不全ウイルスの進化的軍拡競争の解析. 日本進化学会第19回大会 2017.08 京都

  28. Nakano Y, Misawa N, Kimura I, Konno Y, Nagaoka S, Yamamoto K, Aso H, Juarez-Fernandez G, Soper A, Sato K, Koyanagi Y. ヒトAPOBEC3Hとレンチウイルスの攻防. 第20回日本レトロウイルス研究会夏期セミナー 2017.06 熊本

  29. Soper A, Moriwaki M, Misawa N, Yamada E, Nakano Y, Aso H, Yoshikawa R, Sato K, Koyanagi Y. Evaluation of artificial HIV-1 heterogeneity in vitro and in vivo. 第20回日本レトロウイルス研究会夏期セミナー 2017.06 熊本

  30. Soper A, Misawa N, Yamada E, Nakano Y, Moriwaki M, Aso H, Yoshikawa R, Sato K, Koyanagi Y. Evaluation of artificial HIV-1 heterogeneity in vitro and in vivo. 第64回日本ウイルス学会学術集会 2016.10 札幌

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教育上の能力に関する事項 【 表示 / 非表示

  • 所属分野における大学院生・学部生への研究指導補助,2023年04月 - 現在

職務上の実績に関する事項 【 表示 / 非表示

  • 感染症制圧を目指したデータ科学研究とその実験的検証,2023年04月 - 現在