基本情報

写真a

花園 祐矢(ハナゾノ ユウヤ)

HANAZONO Yuya


職名

助教

出身学校 【 表示 / 非表示

  • 京都大学  理学部  2009年03月  卒業

出身大学院 【 表示 / 非表示

  • 京都大学  理学研究科  化学専攻  修士課程  2011年03月  修了

  • 京都大学  理学研究科  化学専攻  博士課程  2014年03月  修了

取得学位 【 表示 / 非表示

  • 博士(理学)  

経歴(学内) 【 表示 / 非表示

  • 2021年07月
    -
    現在
    東京医科歯科大学 難治疾患研究所 先端分子医学研究部門 分子構造情報学 助教
  • 2021年07月
    -
    現在
    東京医科歯科大学 大学院医歯学総合研究科 生命理工学系専攻 生命理工学講座 分子構造情報学 助教

経歴(学外) 【 表示 / 非表示

  • 2014年04月
    -
    2015年03月
    日本学術振興会 特別研究員(PD)
  • 2015年04月
    -
    2018年03月
    京都大学 大学院理学研究科化学専攻 特定研究員
  • 2018年04月
    -
    2020年03月
    東北大学 大学院情報科学研究科 学術研究員
  • 2020年04月
    -
    2021年06月
    量子科学技術研究開発機構 量子生命科学領域 博士研究員

研究分野 【 表示 / 非表示

  • 構造生物化学

 

競争的資金等の研究課題 【 表示 / 非表示

  • 高分解能X線および中性子線回折による高電位鉄硫黄タンパク質の酸化還元反応の理解

    文部科学省/日本学術振興会 : 2020年 - 2021年

論文・総説 【 表示 / 非表示

  1. Lensink MF, Brysbaert G, Mauri T, Nadzirin N, Velankar S, Chaleil RAG, Clarence T, Bates PA, Kong R, Liu B, Yang G, Liu M, Shi H, Lu X, Chang S, Roy RS, Quadir F, Liu J, Cheng J, Antoniak A, Czaplewski C, GiełdoŃ A, Kogut M, Lipska AG, Liwo A, Lubecka EA, Maszota-Zieleniak M, Sieradzan AK, Ślusarz R, Wesołowski PA, ZiĘba K, Del Carpio Muñoz CA, Ichiishi E, Harmalkar A, Gray JJ, Bonvin AMJJ, Ambrosetti F, Honorato RV, Jandova Z, Jiménez-García B, Koukos PI, Van Keulen S, Van Noort CW, Réau M, Roel-Touris J, Kotelnikov S, Padhorny D, Porter KA, Alekseenko A, Ignatov M, Desta I, Ashizawa R, Sun Z, Ghani U, Hashemi N, Vajda S, Kozakov D, Rosell M, Rodríguez-Lumbreras LA, Fernandez-Recio J, Karczynska A, Grudinin S, Yan Y, Li H, Lin P, Huang SY, Christoffer C, Terashi G, Verburgt J, Sarkar D, Aderinwale T, Wang X, Kihara D, Nakamura T, Hanazono Y, Gowthaman R, Guest JD, Yin R, Taherzadeh G, Pierce BG, Barradas-Bautista D, Cao Z, Cavallo L, Oliva R, Sun Y, Zhu S, Shen Y, Park T, Woo H, Yang J, Kwon S, Won J, Seok C, Kiyota Y, Kobayashi S, Harada Y, Takeda-Shitaka M, Kundrotas PJ, Singh A, Vakser IA, DapkŪnas J, Olechnovič K, Venclovas Č, Duan R, Qiu L, Zhang S, Zou X, Wodak SJ. Prediction of protein assemblies, the next frontier: The CASP14-CAPRI experiment. Proteins. 2021.12; 89 (12): 1800-1823. ( PubMed, DOI )

  2. Yosuke Inoue, Yuya Hanazono, Kentaro Noi, Akihiro Kawamoto, Masato Kimatsuka, Ryuhei Harada, Kazuki Takeda, Ryoichi Kita, Natsuki Iwamasa, Kyoka Shibata, Keiichi Noguchi, Yasuteru Shigeta, Keiichi Namba, Teru Ogura, Kunio Miki, Kyosuke Shinohara, Masafumi Yohda. Split conformation of Chaetomium thermophilum Hsp104 disaggregase. Structure. 2021.07; 29 (7): 721-730. ( PubMed, DOI )

  3. Yuya Hanazono, Kazuki Takeda, Kunio Miki. Characterization of perdeuterated high-potential iron-sulfur protein with high-resolution X-ray crystallography. Proteins. 2020.02; 88 (2): 251-259. ( PubMed, DOI )

  4. Yang Tai, Kiyofumi Takaba, Yuya Hanazono, Hoang Anh Dao, Kunio Miki, Kazuki Takeda. X-ray crystallographic studies on the hydrogen isotope effects of green fluorescent protein at sub-ångström resolutions. Acta Crystallogr D Struct Biol. 2019.12; 75 (12): 1096-1106. ( PubMed, DOI )

  5. Kiyofumi Takaba, Yang Tai, Haruhiko Eki, Hoang-Anh Dao, Yuya Hanazono, Kazuya Hasegawa, Kunio Miki, Kazuki Takeda. Subatomic resolution X-ray structures of green fluorescent protein. IUCrJ. 2019.05; 6 (3): 387-400. ( PubMed, DOI )

  6. Yuya Hanazono, Kazuki Takeda, Kunio Miki. Co-translational folding of α-helical proteins: structural studies of intermediate-length variants of the λ repressor. FEBS Open Bio. 2018.08; 8 (8): 1312-1321. ( PubMed, DOI )

  7. Hiraku Ohno, Kazuki Takeda, Satomi Niwa, Tomotaka Tsujinaka, Yuya Hanazono, Yu Hirano, Kunio Miki. Crystallographic characterization of the high-potential iron-sulfur protein in the oxidized state at 0.8 Å resolution. PLoS One. 2017.05; 12 (5): e0178183. ( PubMed, DOI )

  8. Yuya Hanazono, Kazuki Takeda, Kunio Miki. Structural studies of the N-terminal fragments of the WW domain: Insights into co-translational folding of a beta-sheet protein. Sci Rep. 2016.10; 6 34654. ( PubMed, DOI )

  9. Yuya Hanazono, Kazuki Takeda, Kunio Miki. Characterization of the Nqo5 subunit of bacterial complex I in the isolated state. FEBS Open Bio. 2016.06; 6 (7): 687-695. ( PubMed, DOI )

  10. Yuya Hanazono, Kazuki Takeda, Satomi Niwa, Masahito Hibi, Naoya Takahashi, Tamotsu Kanai, Haruyuki Atomi, Kunio Miki. Crystal structures of chitin binding domains of chitinase from Thermococcus kodakarensis KOD1. FEBS Lett. 2016.01; 590 (2): 298-304. ( PubMed, DOI )

  11. Yuya Hanazono, Kazuki Takeda, Toshihiko Oka, Tetsuya Abe, Taichi Tomonari, Nobuhiko Akiyama, Yoshiki Aikawa, Masafumi Yohda, Kunio Miki. Nonequivalence observed for the 16-meric structure of a small heat shock protein, SpHsp16.0, from Schizosaccharomyces pombe. Structure. 2013.02; 21 (2): 220-228. ( PubMed, DOI )

  12. Yuya Hanazono, Kazuki Takeda, Masafumi Yohda, Kunio Miki. Structural studies on the oligomeric transition of a small heat shock protein, StHsp14.0. J Mol Biol. 2012.09; 422 (1): 100-108. ( PubMed, DOI )

  13. Kazuki Takeda, Takuro Hayashi, Tetsuya Abe, Yu Hirano, Yuya Hanazono, Masafumi Yohda, Kunio Miki. Dimer structure and conformational variability in the N-terminal region of an archaeal small heat shock protein, StHsp14.0. J Struct Biol. 2011.04; 174 (1): 92-99. ( PubMed, DOI )

▼全件表示

講演・口頭発表等 【 表示 / 非表示

  1. Yuya Hanazono, Yu Hirano, Kazuki Takeda, Katsuhiro Kusaka, Taro Tamada, Kunio Miki. High-resolution structure of an electron-transfer protein by neutron crystallography. The 4th International Forum on Quantum Metrology and Sensing 2021.12.08 on-line

  2. Hafumi Nishi, Yuya Hanazono, Kengo Kinoshita. Comprehensive analysis of genetic variations on human SLC transporters. The 29th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 20th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2021) 2021.07.25 on-line

  3. 大森 聡, 花園 祐矢, 西 羽美, 木下 賢吾. 分子動力学シミュレーションによって明らかになったSLC26A9塩化物イオントランスポーターのゲート運動機構. 第59回日本生物物理学会年会 2021.11.27 オンライン開催