出身大学院 【 表示 ／ 非表示 】
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鳥取大学 大学院医学系研究科 生命科学専攻 修士課程 2009年03月 修了
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鳥取大学 大学院医学系研究科 生命科学専攻 博士課程 2012年03月 単位取得満期退学
経歴(学内) 【 表示 ／ 非表示 】
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2021年04月-2022年04月東京医科歯科大学 難治疾患研究所 ゲノム応用医学研究部門 ゲノム機能情報分野 助教
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2022年05月-現在東京医科歯科大学 難治疾患研究所 バイオデータ科学研究部門 ゲノム機能情報分野 助教
経歴(学外) 【 表示 ／ 非表示 】
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2007年09月-2012年03月鳥取看護大学 非常勤講師
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2012年04月-2016年03月理化学研究所 多能性幹細胞研究チーム リサーチアソシエイト
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2016年04月-2019年01月熊本大学 発生医学研究所 多能性幹細胞分野 特定事業研究員
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2019年01月-2021年03月理化学研究所 バイオインフォマティクス研究開発チーム 研究員
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2021年05月-現在理化学研究所 バイオインフォマティクス研究開発チーム 客員研究員
競争的資金等の研究課題 【 表示 ／ 非表示 】
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新規スクリーニング法を利用した内在性DNAトランスポゾン転移酵素の機能解析
文部科学省/日本学術振興会 : 2019年 - 2021年
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超多検体時系列サンプルを用いた初期分化に関わるシグナル経路の網羅的同定
文部科学省/日本学術振興会
論文・総説 【 表示 ／ 非表示 】
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Morino-Koga S, Tsuruda M, Zhao X, Oshiro S, Yokomizo T, Yamane M, Tanigawa S, Miike K, Usuki S, Yasunaga KI, Nishinakamura R, Suda T, Ogawa M. Transition of signal requirement in hematopoietic stem cell development from hemogenic endothelial cells. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2024.07; 121 (31): e2404193121. ( PubMed, DOI )
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Mwalilino L, Yamane M, Ishiguro KI, Usuki S, Endoh M, Niwa H. The role of Zfp352 in the regulation of transient expression of 2-cell specific genes in mouse embryonic stem cells. Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms. 2023.12; 28 (12): 831-844. ( PubMed, DOI )
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Sano H, Nakamura A, Yamane M, Niwa H, Nishimura T, Araki K, Takemoto K, Ishiguro KI, Aoki H, Kato Y, Kojima M. The polyol pathway is an evolutionarily conserved system for sensing glucose uptake. PLoS biology. 2022.06; 20 (6): e3001678. ( PubMed, DOI )
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Naganuma H, Miike K, Ohmori T, Tanigawa S, Ichikawa T, Yamane M, Eto M, Niwa H, Kobayashi A, Nishinakamura R. Molecular detection of maturation stages in the developing kidney. Developmental biology. 2021.02; 470 62-73. ( PubMed, DOI )
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Takemoto K, Tani N, Takada-Horisawa Y, Fujimura S, Tanno N, Yamane M, Okamura K, Sugimoto M, Araki K, Ishiguro KI. Meiosis-Specific C19orf57/4930432K21Rik/BRME1 Modulates Localization of RAD51 and DMC1 to DSBs in Mouse Meiotic Recombination. Cell reports. 2020.05; 31 (8): 107686. ( PubMed, DOI )
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Ishiguro KI, Matsuura K, Tani N, Takeda N, Usuki S, Yamane M, Sugimoto M, Fujimura S, Hosokawa M, Chuma S, Ko MSH, Araki K, Niwa H. MEIOSIN Directs the Switch from Mitosis to Meiosis in Mammalian Germ Cells. Developmental cell. 2020.02; 52 (4): 429-445.e10. ( PubMed, DOI )
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Nasser H, Adhikary P, Abdel-Daim A, Noyori O, Panaampon J, Kariya R, Okada S, Ma W, Baba M, Takizawa H, Yamane M, Niwa H, Suzu S. Establishment of bone marrow-derived M-CSF receptor-dependent self-renewing macrophages. Cell death discovery. 2020; 6 63. ( PubMed, DOI )
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Yamane M, Ohtsuka S, Matsuura K, Nakamura A, Niwa H. Overlapping functions of Krüppel-like factor family members: targeting multiple transcription factors to maintain the naïve pluripotency of mouse embryonic stem cells. Development (Cambridge, England). 2018.05; 145 (10): ( PubMed, DOI )
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Mariko Yamane, Setsuko Fujii, Satoshi Ohtsuka, Hitoshi Niwa. Zscan10 is dispensable for maintenance of pluripotency in mouse embryonic stem cells BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS. 2015.12; 468 (4): 826-831. ( PubMed, DOI )
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Masaki Kinoshita, Daisuke Shimosato, Mariko Yamane, Hitoshi Niwa. Sox7 is dispensable for primitive endoderm differentiation from mouse ES cells BMC DEVELOPMENTAL BIOLOGY. 2015.10; 15 37. ( PubMed, DOI )
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Setsuko Fujii, Satomi Nishikawa-Torikai, Yoko Futatsugi, Yayoi Toyooka, Mariko Yamane, Satoshi Ohtsuka, Hitoshi Niwa. Nr0b1 is a negative regulator of Zscan4c in mouse embryonic stem cells SCIENTIFIC REPORTS. 2015.03; 5 9146. ( PubMed, DOI )
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Shunsuke Ito, Mariko Yamane, Satoshi Ohtsuka, Hitoshi Niwa. The C-terminal region of Xpc is dispensable for the transcriptional activity of Oct3/4 in mouse embryonic stem cells FEBS LETTERS. 2014.04; 588 (7): 1128-1135. ( PubMed, DOI )
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Masaki Shigeta, Satoshi Ohtsuka, Satomi Nishikawa-Torikai, Mariko Yamane, Setsuko Fujii, Kazuhiro Murakami, Hitoshi Niwa. Maintenance of pluripotency in mouse ES cells without Trp53 Scientific Reports. 2013.10; 3 2944. ( PubMed, DOI )
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Tomoko Nakanishi, Rumiko Saito, Makoto Taniguchi, Haruka Oda, Atsumi Soma, Mayu Yasunaga, Mariko Yamane, Kenzo Sato. In Vivo Determination of Vitamin D Function Using Transgenic Mice Carrying a Human Osteocalcin Luciferase Reporter Gene BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL. 2013; 2013 895706. ( PubMed, DOI )
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Naohiro Hori, Mariko Yamane, Kaori Kouno, Kenzo Sato. Induction of DNA Demethylation Depending on Two Sets of Sox2 and Adjacent Oct3/4 Binding Sites (Sox-Oct Motifs) within the Mouse H19/Insulin-like Growth Factor 2 (Igf2) Imprinted Control Region JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. 2012.12; 287 (52): 44006-44016. ( PubMed, DOI )
書籍等出版物 【 表示 ／ 非表示 】
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山根万里子. ヒト初期発生での不均衡性な細胞分裂はいつからはじまるのか？. 羊土社, 2024.09 (ISBN : 978-4-7581-2583-3)
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山根万里子. 脱分化を抑えて分化の一方向性を保つ因子の同定―転写開始点近傍の配列情報から探る. 2023.07 (ISBN : 978-4-7581-2569-7)
講演・口頭発表等 【 表示 ／ 非表示 】
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Mariko Yamane 他. Decoding the Intricate Signaling Orchestration in Early Human Development: A Temporally Resolved Transcriptomic Approach with Comprehensive Chemical Pertuabations. 57th JSDB annual meeting 2024.06.22 京都みやこめっせ
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Mariko Yamane 他. Atlas-class transcriptome analysis of human iPS cell differentiation by using bulk-Quartz-seq2 in a single small research team.. 第１８回生命医科学研究所ネットワーク国際シンポジウム 2023.10.06 東京医科歯科大学
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山根 万里子, 笹川 洋平, 岩山 佳美, 的場 綾子, 二階堂 愛 . 少人数の単一研究室によるbulk-Quartz-Seq2を用いたヒトiPS細胞の分化誘導における超多検体トランスクリプトーム解析. 第44回日本分子生物学会年会 2021.12.02 パシフィコ横浜
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山根万里子. 超多検体トランスクリプトームの解析方法. NGS座談会 2024.08.07 熊本大学発生医学研究所
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山根万里子 他. 超多検体時系列サンプルを用いた初期分化に関わるシグナル経路の網羅的同定. 第46回日本分子生物学会年会 2023.12.08 神戸ポートアイランド
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佐野 浩子, 中村 輝, 山根 万里子, 丹羽 仁史, 西村 隆史, 荒木 喜美, 竹本 一政, 石黒 啓一郎, 西方 美由紀, 青木 浩樹, 児島 正康. 栄養素代謝による細胞制御とその破綻 ポリオール経路によるグルコース摂取感知機構. 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 2021.11.01
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山根 万里子, 市川 巧, 丹羽 仁史. Zscan10はマウスES細胞においてトランスポゾン領域のサイレンシングを抑制する. 生命科学系学会合同年次大会 2017.12.01
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市川 巧, 山根 万里子, 松浦 公美, 小田 真由美, 洪 実, 丹羽 仁史. マウスES細胞をモデルとしたChIP-SeqおよびRNA-Seq解析データの統合アプローチ. 生命科学系学会合同年次大会 2017.12.01