Yusuke Ota, Reina Okada, Hideyuki Takahashi, Ryoichi Saito. Molecular detection of fluoroquinolone-resistant Neisseria meningitidis by using Mismatched PCR-restriction fragment length polymorphism technique Frontiers in Cellular and Infection Microbiology . 2022.07; 12 911911.

Ryoichi Saito, Jun Nakajima, Isaac Prah, Masatomo Morita, Samiratu Mahazu, Yusuke Ota, Ayuka Kobayashi, Shuji Tohda, Hajime Kamiya, Hideyuki Takahashi, Makoto Ohnishi. Penicillin- and ciprofloxacin-resistant invasive Neisseria meningitidis isolates from Japan. Microbiol Spectr. 2022.06; 10 (3): e0062722.

Yusuke Ota, Isaac Prah, Yoko Nukui, Ryuji Koike, Ryoichi Saito. blaKPC-2-encoding IncP-6 plasmids in Citrobacter freundii and Klebsiella variicola strains from hospital sewage in Japan. Appl Environ Microbiol. 2022.04; 88 (8): e0001922.

Yusuke Ota, Natsune Hongou, Yoko Nukui, Ryuji Koike, Shuji Tohda, Ryoichi Saito. Evaluation of polymerase chain reaction-based open reading frame typing method for the clonality investigation of Clostridioides difficile isolates. Anaerobe. 2021.12; 72 102462.

Yusuke Ota, Kazuki Furuhashi, Nachi Hirai, Jinko Ishikawa, Osanori Nagura, Katsumasa Yamanaka, Masato Maekawa. Evaluation of MBT STAR-Cepha and MBT STAR-Carba kits for the detection of extended-spectrum β-lactamases and carbapenemase producing microorganisms using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry. Journal of Microbiological Methods. 2021.04; 183 (106166 ):

Yusuke Ota, Kazuki Furuhashi, Wataru Hayashi, Nachi Hirai, Jinko Ishikawa, Osanori Nagura, Katsumasa Yamanaka, Kazuto Katahashi, Kotaro Aoki, Noriyuki Nagano, Masato Maekawa. Daptomycin resistant Enterococcus faecalis has a mutation in liaX, which encodes a surface protein that inhibits the LiaFSR systems and cell membrane remodeling. Journal of infection and chemotherapy. 2021.01; 27 90-93.

Takehisa Matsumoto, Masayuki Hashimoto, Ching-Hao Teng, Po-Chuen Hsu, Yusuke Ota, Masaru Takamizawa, Ryosuke Kato, Tatsuya Negishi. Molecular characterization of a carbon dioxide-dependent Escherichia coli small-colony variant isolated from blood cultures. International journal of medical microbiology. 2020.07; 310 (5): 151431.

Yusuke Ota, Kazuki Furuhashi, Yuki Nagao, Takamasa Nanba, Katsumasa Yamanaka, Jinko Ishikawa, Osanori Natura, Moriya Iwaizumi, Etsuko Hamada, Masato Maekawa. Detection of extended-spectrum β-lactamases producing Enterobacteriaceae using a matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry based MBT STAR-BL software module with β-lactamase inhibition assay depends on the bacterial strain. J Microbiological Methods. 2019.12; 167 105734.

太田悠介, 古橋一樹, 長尾侑紀, 山中勝正, 濵田悦子, 前川真人. 全自動尿中有形成分分析装置UF-5000による Escherichia coli を対象とした迅速な薬剤感受性検査法の構築. 臨床病理. 2019.06; 67 (6): 569-576.

Yusuke Ota, Kazuki Furuhashi, Takamasa Nanba, Katsumasa Yamanaka, Jinko Ishikawa, Osanori Nagura, Etsuko Hamada, Masato Maekawa. A rapid and simple detection method for phenotypic antimicrobial resistance in Escherichia coli by loop-mediated isothermal amplification. Journal of Medical Microbiology. 2019.02; 68 (2): 169-177. ( DOI )

Kazuki Horiuchi, Takehisa Matsumoto, Yusuke Ota, Eriko Kasuga, Tatsuya Negishi, Tomomi Yaguchi, Mitsutoshi Sugano, Takayuki Honda. Addition of thymidine to culture media for accurate examination of thymidine-dependent small-colony variants of methicillin-resistant Staphylococcus aureus: A pilot study. Journal of Microbiological Methods. 2015.03; 110 40-44.

名倉理教、古橋一樹、長尾侑紀、太田悠介、石川仁子、前川真人. 血液培養から検出されたCandida属のCHROMagar Candidaを用いた推定とMALDI-TOF MSによる同定法の比較検討 日本臨床微生物学会雑誌. 2023; 33 (2): 116-120.

園屋陽平、福田修、太田悠介、齋藤良一、住田善之、金子幸弘、佐田誠. グラム染色報告での早期の菌種推定が有効な初期抗菌薬の選択に繋がったLacticaseibacillus paracaseiによる感染性心内膜炎症例 日本臨床微生物学会雑誌. 2023; in press

夏木茜、堀雅之、松原康策、太田悠介、齋藤良一、磯目賢一、岩田あや、池町真実、竹川啓史、山本剛、大楠美佐子、石和田稔彦. 基礎疾患のない 3 歳児に発症した Moraxella catarrhalis 菌血症 感染症学雑誌. 2022; 96 (6): 240-244.

夏木 茜, 堀 雅之, 松原 康策, 太田 悠介, 齋藤 良一, 磯目 賢一, 岩田 あや, 池町 真実, 竹川 啓史, 山本 剛, 大楠 美佐子, 石和田 稔彦. 基礎疾患のない 3 歳児に発症した Moraxella catarrhalis 菌血症 感染症学雑誌. 2022; 96 (6): 240-244.

太田 悠介，松本 竹久，菅野 光俊，本田 孝行. Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry による Staphylococcus aureus Thymidine-Dependent Small-Colony Variants を対象とした同定性能の検討. 臨床病理. 2015; 63 (6): 683-687.

太田 悠介, 松本 竹久, 春日 恵理子, 堀内 一樹, 根岸 達哉, 矢口 ともみ, 名取 達矢. アスペルギローマ患者の喀痰及び肺組織よりSerratia marcescensのSmall-colony variantを検出した1症例. 日本臨床微生物学会雑誌. 2015; 25 (2): 125-130.

太田 悠介, 松本 竹久, 春日 恵理子, 堀内 一樹, 根岸 達哉, 矢口 ともみ, 名取 達矢. 質量分析装置MALDIバイオタイパーによるStreptococcus属菌を対象とした同定性能の検討. 日本臨床微生物学会雑誌. 2015; 25 (2): 111-116.

太田 悠介, 松本 竹久, 春日 恵理子, 堀内 一樹, 根岸 達哉, 矢口 ともみ, 高見沢 将, 村上 将貴. Dysgonomonas mossii及びDysgonomonas capnocytophagoides を対象とした臨床細菌学的検討. 日本臨床微生物学会雑誌. 2014; 24 (3): 207-212.

Yikeshan Yalikun, Isaac Prah, Samiratu Mahazu, Yusuke Ota, Ryoichi Saito. Genomic and population insight of ESBL-producing Klebsiella pneumoniae from Ghana. 第34回日本臨床微生物学会総会・学術集会 2023.02.03

Yusuke Ota, Reina Okada, Hideyuki Takahashi, Ryoichi Saito. Rapid and simple PCR-RFLP assay for detecting a mutation at codon 91 of gyrA in Neisseria meningitidis. The 17th Congress of Asian Society of Clinical Pathology and Laboratory Medicine（ASCPaLM） 2022.10.09

Yikeshan Yalikun, Isaac Prah, Samiratu Mahazu, Yusuke Ota, Anthony Ablordey, Ryoichi Saito. Characterization of extended-spectrum β-lactamase producing Klebsiella pneumoniae from Ghana. The 17th Congress of Asian Society for Clinical Pathology and Laboratory Medicine 2022.10.09

Samiratu Mahazu, Isaac Prah, Yusuke Ota, Takaya Hayashi, Yoko Nukui, Masato Suzuki, Yoshihiko Hoshino, Yukihiro Akeda, Toshihiko Suzuki, Tomoko Ishino, Anthony Ablordey, Ryoichi Saito. Klebsiella species and Enterobacter cloacae isolates harbouring blaOXA-181 and blaOXA-48: resistome, fitness cost, and plasmid stability. The 17th Congress of Asian Society for Clinical Pathology and Laboratory Medicine 2022.10.09

Taira Kawamura, Akari Samejima, Yukino Usui, Issac Prah, Samiratu Mahazu, Yusuke Ota, Ryoichi Saito. Role of cyclic-di-AMP phosphodiesterase on vancomycin susceptibility and growth in Clostridioides difficile. The 17th Congress of Asian Society for Clinical Pathology and Laboratory Medicine 2022.10.09

Kayo Yamada, Alafate Ayibieke, Samiratu Mahazu, Isaac Prah, Yusuke Ota, Yoko Nukui, Ryuji Koike, Shuji Tohda, Ryoichi Saito. Genetic and phenotypic features of Staphylococcus epidermidis ST2 bloodstream isolates from Tokyo. The 17th Congress of Asian Society for Clinical Pathology and Laboratory Medicine 2022.10.09

Y Nukui, Y Ota, I Prah, R Saito, Y Aiso, M Sugii, S Kanehira, J Nakajima, K Sonobe, S Tohda, R Koike, Y Gu. Molecular Epidemiological Analysis of Third Generation Cephalosporin and Piperacillin/Tazobactam-Resistant Klebsiella oxytoca, Which Caused an Outbreak in a COVID-19 Intensive Care Unit. ASM Microbe 2022.06.10 Washington, DC

Kayo Yamada, Alafate Ayibieke, Samiratu Mahazu, Isaac Prah, Yusuke Ota, Yoko Nukui, Ryuji Koike, Shuji Tohda, Ryoichi Saito. Novel insights and genetic features of Staphylococcus epidermidis bloodstream isolates from Tokyo. ASM Microbe 2022.06.10

Samiratu Mahazu, Isaac Prah, Yusuke Ota, Takaya Hayashi, Yoko Nukui, Yukihiro Akeda, Toshihiko Suzuki, Tomoko Ishino, Anthony Ablordey, Ryoichi Saito. Molecular characterization of Klebsiella pneumoniae and Enterobacter cloacae isolates harboring blaOXA-181 and blaOXA-48. ASM Microbe 2022.06.10

Ota Y, Furuhashi K, Nanba T, Yamanaka K, Ishikawa J, Nagura O, Hamada E, Maekawa M. Loop-mediated Isothermal Amplification-based Antimicrobial Susceptibility Testing in Escherichia coli. The 57th Congress of the Korean Association of Medical Technologists International Conference 2019

酒井幸音、Isaac Prah、太田悠介、Samiratu Mahazu、具　芳明、東田修二、齋藤良一. 渡航歴無し入院患者由来NDM-５型カルバペネマーゼCitrobacter koseriのゲノム疫学解析. 第17回日本臨床検査学教育学会学術大会 2023.08 奈良

陳 菲、太田 悠介、具 芳明、小池 竜司、齋藤 良一 . 病院排水から分離されたGES型及びIMP型カルバペネマーゼ産生菌の全ゲノム解析. 第17回日本臨床検査学教育学会学術大会 2023.08 奈良

太田悠介、具芳明、小池竜司、齋藤良一. 病院排水より分離されたGES型カルバペネマーゼ産生菌のゲノム解析. 第97回日本感染症学会総会・学術講演会 2023.04 横浜

太田悠介、齋藤良一. Ciprofloxacin耐性Neisseria meningitidisにおけるgyrA変異検出用ミスマッチPCR法の構築. 第34回日本臨床微生物学会総会・学術集会 2023.02.03

園屋陽平、福田修、太田悠介、齋藤良一、金子幸弘. 血液培養陽性時のグラム染色による推定菌種報告が初期抗菌薬選択の一助となったLacticaseibacillus paracaseiによる感染性心内膜炎の1例. 第34回日本臨床微生物学会総会・学術集会 2023.02.03

河村平、鮫島朱里、臼井雪乃、Isaac Prah、Samiratu Mahazu、太田悠介、齋藤良一. Clostridioides difficileのバンコマイシン耐性化機序に関する研究. 第34回日本臨床微生物学会総会・学術集会 2023.02.03

松葉美帆、太田悠介、齋藤良一. 迅速簡便なNeisseria meningitidisの同定および血清群別測定系の開発. 第34回日本臨床微生物学会総会・学術集会 2023.02.03

山田華代1、Alafate Ayibieke1, Samiratu Mahazu1, Isaac Prah, 山田景土, 荻原真二, 太田悠介, 貫井陽子, 東田修二, 齋藤良一. 世界的流行系統のメチシリン耐性S. epidermidisにおける薬剤耐性および病原性の解析. 第34回日本臨床微生物学会総会・学術集会 2023.02.03

Samiratu Mahazu, Isaac Prah, Yusuke Ota, Takaya Hayashi, Yoko Nukui, Masato Suzuki, Yoshihiko Hoshino, Yukihiro Akeda, Toshihiko Suzuki, Tomoko Ishino, Anthony Ablordey, Ryoichi Saito. Genetic analysis of carbapenemase-producing Enterobacter cloacae and Klebsiella species. 第34回日本臨床微生物学会総会・学術集会 2023.02.03

Isaac Prah, Ayaha Suzuki, Samiratu Mahazu, Yusuke Ota, Anthony Ablordey, Ryoichi Saito. Molecular characterization of carbapenem resistant isolates from hospital sewage samples in Ghana. 第34回日本臨床微生物学会総会・学術集会 2023.02.03

安永慶、太田悠介、齋藤良一. MiniSeqシステムによる16S rRNA遺伝子V4領域を標的とした菌叢解析の有用性評価. 第34回日本臨床微生物学会総会・学術集会 2023.02.03

太田　悠介. 臨床検査への応用を見据えた薬剤耐性の新規検査法開発の試み. 第 34 回日本臨床微生物学会総会・学術集会 2023.02.03

太田悠介、佐々（谷）千尋、東田修二、齋藤良一. 訪問看護事業所の流し台より分離されたイミペネム 低感受性Enterobacter roggenkampiiの全ゲノム解析. 第34回日本臨床微生物学会総会・学術集会 2023.02.03

太田悠介、貫井陽子、東田修二、齋藤良一. Clostridioides difficileの分子疫学解析におけるPCR-based ORF Typing法の有用性の検討 . 第33回日本臨床微生物学会総会・学術集会 2022.01

太田悠介、貫井陽子、小池竜司、東田修二、齋藤良一. PCR-based ORF Typing法を用いたClostridioides difficileの分子疫学解析の検討 . 2021.10

太田悠介，古橋一樹，石川仁子，名倉理教，前川真人. Daptomycin投与患者より分離されたdaptomycin非感受性Enterococcus faecalisの遺伝子解析. 第31回日本臨床微生物学会総会 2020

太田悠介. 質量分析装置の更なる臨床活用を目指して 〜MBT STAR-BLを中心に〜. 第5回日本医用マススペクトル学会東部会 2020

太田悠介，古橋一樹，山中勝正，前川真人. 質量分析による薬剤耐性検出アッセイMBT STAR-BLを用いた基質拡張型βラクタマーゼ産生株の検出能の評価. 第67回日本臨床検査医学会学術集会 2020

太田悠介，古橋一樹，山中勝正，濵田悦子，前川真人. 質量分析による薬剤耐性検出アッセイMBT STAR-BLを活用した薬剤耐性菌検出の試み. 第60回日本臨床化学会年次学術集会 2020

太田悠介，古橋一樹，山中勝正，濵田悦子，前川真人. 質量分析による薬剤耐性検出アッセイMBT STAR-BLを用いたカルバペネマーゼ 及びESBL産生株の検出能の評価. 第60回日本臨床化学会年次学術集会 2020

古橋 一樹, 名倉 理教, 太田 悠介, 山中 勝正, 山下 計太, 岩泉 守哉, 前川 真人. Clostridioides difficile感染症の診断における便培養陽性時のNucleic acid amplification testの測定意義. 臨床病理 2020

平井 那知, 太田 悠介, 山中 勝正, 山下 計太, 古橋 一樹, 前川 真人. SARS-CoV-2の検出における4種類のPCR検査試薬を対象とした最小検出濃度の比較検討. 臨床病理 2020

増川 陽大, 古橋 一樹, 太田 悠介, 山中 勝正, 山下 計太, 岩泉 守哉, 濱田 悦子, 前川 真人. HISCLプレセプシン試薬の基礎性能評価と集中治療室入院患者におけるプレセプシンと他のパラメータとの関連. 臨床病理 2020

古橋 一樹, 名倉 理教, 長尾 侑紀, 太田 悠介, 石川 仁子, 岩泉 守哉, 前川 真人. 当院で過去12年間に血液培養から検出されたCandida属のMALDI-TOF MSを用いた再同定と経年的変化の検討. 臨床病理 2019.10.01

太田悠介，古橋一樹，長尾侑紀，山中勝正，岩泉守哉，濵田悦子，前川真人. βラクタマーゼ阻害薬を用いたMBT STAR-BLによるESBLとその他のβラクタマーゼ産生株との正確な判別法. 第66回日本臨床検査医学会学術集会 2019

太田悠介，濵田悦子，古橋一樹，納富継宣，前川真人. Loop-mediated isothermal amplification法によるEscherichia coliを対象とした迅速な薬剤感受性検査法の構築. 第31回臨床微生物迅速診断研究会 2019

太田悠介，濵田悦子，古橋一樹，納富継宣，前川真人. Escherichia coliを対象とした迅速な薬剤感受性検査法の構築. 第59回日本臨床化学会年次学術集会 2019

太田悠介，濵田悦子，古橋一樹，前川真人. 全自動尿中有形成分分析装置UF-5000を使用した迅速な薬剤感受性検査法の構築. 第65回日本臨床検査医学会学術集会 2018

太田悠介，濵田悦子，古橋一樹，納富継宣，前川真人. Loop-mediated isothermal amplification法による迅速な薬剤感受性検査法の構築. 第58回日本臨床化学会年次学術総会 2018

太田悠介，濵田悦子，前川真人. 新規開発された腎障害の早期マーカー『ノルディアL-FABP』のLABOSPECT 008における有用性評価. 日本臨床検査自動化学会第47回大会 2015

太田悠介，松本竹久，春日恵理子，堀内一樹，根岸達哉，矢口ともみ，名取達矢. MALDIバイオタイパーを使用したStreptococcus pneumoniaeとその類縁菌種の鑑別. 第26回日本臨床微生物学会総会 2015

太田悠介，松本竹久，春日恵理子，堀内一樹，根岸達哉，矢口ともみ，名取達矢. オレイン酸要求性 Staphylococcus epidermidis を対象とした細菌学的検討. 第26回日本臨床微生物学会総会 2015

太田悠介. 日常検査で役立つ多剤耐性菌の迅速簡便検出法 (PRSP実務委員). 第26回日本臨床微生物学会総会 2015

太田悠介，松本竹久，春日恵理子，堀内一樹，根岸達哉，矢口ともみ，名取達矢，菅野光俊. Random amplified polymorphic DNA fingerprinting 法を使用した Helicobacter pylori家族内感染の検討. 第40回長野県臨床検査学会 2014

太田悠介，松本竹久，春日恵理子，堀内一樹，根岸達哉，矢口ともみ，金井信一郎. Staphylococcus capraeのSmall-colony variantを対象とした細菌学的検討. 第25回日本臨床微生物学会総会 2014

太田悠介，松本竹久，春日恵理子，堀内一樹，根岸達哉，矢口ともみ，金井信一郎. 喀痰及び肺組織よりSerratia marcescensのSmall-colony variantを検出した1症例. 第25回日本臨床微生物学会総会 2014

太田悠介，松本竹久，春日恵理子，堀内一樹，根岸達哉，矢口ともみ，菅野光俊. 血液培養より分離され，Klebsiella oxytocaと誤同定されたRaoultella ornithinolyticaの細菌学的検討. 第63回日本医学検査学会 2014

太田悠介，松本竹久，春日恵理子，堀内一樹，根岸達哉，矢口ともみ，菅野光俊. ヘモフィルスID4分画培地及びヘモフィルス感受性培地に発育不良を示したHaemophilus influenzae. 第63回日本医学検査学会 2014

太田悠介，松本竹久，春日恵理子，堀内一樹，根岸達哉，矢口ともみ，名取達矢，菅野光俊. 質量分析装置MALDIバイオタイパーによるStreptococcus属菌を対象とした同定性能の検討. 第51回日臨技関甲信支部医学検査学会 2014

太田悠介，松本竹久，春日恵理子，堀内一樹，根岸達哉，矢口ともみ，名取達矢，菅野光俊. 血液培養よりRaoultella ornithinolyticaが分離された3症例. 第51回日臨技関甲信支部医学検査学会 2014

太田悠介，松本竹久，春日恵理子，堀内一樹，根岸達哉，矢口ともみ，名取達矢，菅野光俊. 血液培養から分離されたα溶血性グラム陽性球菌の遺伝子学的同定. 第40回長野県臨床検査学会 2014

太田悠介，松本竹久，春日恵理子，堀内一樹，根岸達哉，矢口ともみ，菅野光俊. 下腿切断創部と血液培養からYokenella regensburgeiが分離された一症例. 第39回長野県臨床検査学会 2013

太田悠介，松本竹久，春日恵理子，堀内一樹，根岸達哉，矢口ともみ，菅野光俊. 迅速微生物同定システムMALDI Biotyperを用いたStaphylococcus属菌のSmall Colony Variantsを対象とした同定検査の検討. 第62回日本医学検査学会 2013

太田悠介，松本竹久，春日恵理子，堀内一樹，根岸達哉，矢口ともみ，菅野光俊. MALDI Biotyper による偏性嫌気生菌を対象とした同定性能の検討. 第50回関甲信支部医学検査学会 2013