基本情報

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伊藤 暢聡(イトウ ノブトシ)

ITO Nobutoshi


職名

教授

生年

1963年

研究室住所

東京都文京区湯島1-5-45 M&Dタワー22階

研究室電話番号

+81-3-5803-4594

研究室FAX番号

+81-3-5803-4594

メールアドレス

ito.str@tmd.ac.jp

研究分野・キーワード

構造生物学、X線結晶解析、Protein Data Bank

出身学校 【 表示 / 非表示

  • 東京大学  工学部  物理工学科  1986年03月  卒業

出身大学院 【 表示 / 非表示

  • 東京大学  工学系研究科  物理工学専攻  修士課程  1988年03月  修了

  • リーズ大学  博士課程  1991年08月  修了

取得学位 【 表示 / 非表示

  • Ph D  リーズ大学

経歴(学内) 【 表示 / 非表示

  • 2012年04月
    -
    2022年04月
    東京医科歯科大学 難治疾患研究所 先端分子医学研究部門 分子構造情報学 教授
  • 2012年04月
    -
    現在
    東京医科歯科大学 大学院医歯学総合研究科 生命理工学系専攻 生命理工学講座 分子構造情報学 教授
  • 2003年04月
    -
    2012年03月
    東京医科歯科大学 大学院生命情報科学教育部/大学院疾患生命科学研究部 教授
  • 2022年05月
    -
    現在
    東京医科歯科大学 難治疾患研究所 バイオデータ科学研究部門 分子構造情報学分野 教授

経歴(学外) 【 表示 / 非表示

  • 1991年08月
    -
    1992年06月
    リーズ大学(英国) Research Fellow
  • 1992年07月
    -
    1994年11月
    MRC Laboratory of Molecular Biology (英国) Scientific Staff
  • 1994年12月
    -
    1996年05月
    リーズ大学(英国) Research Fellow
  • 1996年06月
    -
    2001年07月
    生物分子工学研究所  主任研究員
  • 2001年08月
    -
    2003年03月
    科学技術振興事業団 研究員

所属学協会 【 表示 / 非表示

  • 日本生物物理学会

  • 日本蛋白質科学会

  • 日本ケミカルバイオロジー学会

研究分野 【 表示 / 非表示

  • 構造生物化学

  • 生物物理学

  • ケミカルバイオロジー

 

競争的資金等の研究課題 【 表示 / 非表示

  • APOBEC3のデアミナーゼ活性非依存ウイルス抑制の分子機構

    文部科学省/日本学術振興会 : 2018年 - 2020年

  • 新規コンセプトによる炎症を誘導しないワクチン用免疫増強剤の開発

    厚生労働省 : 2013年04月 - 2016年03月

  • 癌細胞由来のペプチドと免疫関連タンパク質の複合体構造予測法と親和性予測法の開発

    文部科学省/日本学術振興会

  • 全身性エリテマトーデス抑制因子としてのB細胞共受容体の構造研究

    文部科学省/日本学術振興会

  • Bリンパ球を用いたレクチンを起点とする細胞表面分子ネットワークの機能解明

    文部科学省/日本学術振興会

  • Bリンパ球を用いたレクチンを起点とする細胞表面分子ネットワークの機能解明

    文部科学省/日本学術振興会

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論文・総説 【 表示 / 非表示

  1. Imai D, Numoto N, Tokiwa H, Kakuta H, Ito N. Structural basis for the full and partial agonist activities of retinoid X receptor α ligands with an iso-butoxy and an isopropyl group. Biochemical and biophysical research communications. 2024.08; 734 150617. ( PubMed, DOI )

  2. Yoshida M, Hanazono Y, Numoto N, Nagao S, Yabuno S, Kitagawa Y, Sekiguchi H, Ito N, Azuma T, Oda M. Affinity-matured antibody with a disulfide bond in H-CDR3 loop. Archives of biochemistry and biophysics. 2024.06; 758 110068. ( PubMed, DOI )

  3. Akatsu C, Tsuneshige T, Numoto N, Long W, Uchiumi T, Kaneko Y, Asano M, Ito N, Tsubata T. CD72 is an inhibitory pattern recognition receptor that recognizes ribosomes and suppresses production of anti-ribosome autoantibody. Journal of autoimmunity. 2024.05; 146 103245. ( PubMed, DOI )

  4. Bekker GJ, Numoto N, Kawasaki M, Hayashi T, Yabuno S, Kozono Y, Shimizu T, Kozono H, Ito N, Oda M, Kamiya N. Elucidation of binding mechanism, affinity and complex structure between mWT1 tumor-associated antigen peptide and HLA-A*24:02. Protein Science. 2023.09; 32 (10): e4775. ( PubMed, DOI )

  5. Hall D, Basu G, Ito N. Computational biophysics and structural biology of proteins-a Special Issue in honor of Prof. Haruki Nakamura's 70th birthday. Biophysical reviews. 2022.12; 14 (6): 1211-1222. ( PubMed, DOI )

  6. Nobutaka Numoto, Seiko Onoda, Yoshiaki Kawano, Hideo Okumura, Seiki Baba, Yoshihiro Fukumori, Kunio Miki, Nobutoshi Ito. Structures of oxygen dissociation intermediates of 400 kDa V2 hemoglobin provide coarse snapshots of the protein allostery. Biophys Physicobiol. 2022.05; 19 1-10. ( PubMed, DOI )

  7. Oda Masayuki, Sano Tomoki, Kamatari Yuji O., Abe Yoshito, Ikura Teikichi, Ito Nobutoshi. Structural Analysis of Hen Egg Lysozyme Refolded after Denaturation at Acidic pH PROTEIN JOURNAL. 2022.02; 41 (1): 71-78. ( PubMed, DOI )

  8. Basu G, Hall D, Ito N. Special Issue call: Computational biophysics and structural biology of proteins-A Special Issue in honor of Prof. Haruki Nakamura's 70th birthday. Biophysical reviews. 2022.02; 14 (1): 21-22. ( PubMed, DOI )

  9. Fujioka Toshifumi, Numoto Nobutaka, Akama Hiroyuki, Shilpa Kola, Oka Michiko, Roy Prodip K., Krishna Yarkali, Ito Nobutoshi, Baker David, Oda Masayuki, Tanaka Fujie. Varying the Directionality of Protein Catalysts for Aldol and Retro-Aldol Reactions CHEMBIOCHEM. 2022.01; 23 (2): e202100435. ( PubMed, DOI )

  10. Yoshihara Ayana, Kawasaki Haru, Masuno Hiroyuki, Takada Koki, Numoto Nobutaka, Ito Nobutoshi, Hirata Naoya, Kanda Yasunari, Ishizawa Michiyasu, Makishima Makoto, Kagechika Hiroyuki, Tanatani Aya. Lithocholic Acid Amides as Potent Vitamin D Receptor Agonists BIOMOLECULES. 2022.01; 12 (1): ( PubMed, DOI )

  11. Numoto Nobutaka, Onoda Seiko, Kawano Yoshiaki, Okumura Hideo, Baba Seiki, Fukumori Yoshihiro, Miki Kunio, Ito Nobutoshi. 400kDa V2ヘモグロビンの酸素解離中間体の構造は蛋白質アロステリーの粗スナップショットを提供する(Structures of oxygen dissociation intermediates of 400 kDa V2 hemoglobin provide coarse snapshots of the protein allostery) Biophysics and Physicobiology. 2022; 19 e190019_1-e190019_10. ( 医中誌 )

  12. Tanaka H, Kondo K, Fujita K, Homma H, Tagawa K, Jin X, Jin M, Yoshioka Y, Takayama S, Masuda H, Tokuyama R, Nakazaki Y, Saito T, Saido T, Murayama S, Ikura T, Ito N, Yamamori Y, Tomii K, Bianchi ME, Okazawa H. HMGB1 signaling phosphorylates Ku70 and impairs DNA damage repair in Alzheimer's disease pathology. Communications biology. 2021.10; 4 (1): 1175. ( PubMed, DOI )

  13. Kondo K, Ikura T, Tanaka H, Fujita K, Takayama S, Yoshioka Y, Tagawa K, Homma H, Liu S, Kawasaki R, Huang Y, Ito N, Tate SI, Okazawa H. Hepta-Histidine Inhibits Tau Aggregation. ACS chemical neuroscience. 2021.08; 12 (16): 3015-3027. ( PubMed, DOI )

  14. Senga Akane, Numoto Nobutaka, Yamashita Mitsuaki, Iida Akira, Ito Nobutoshi, Kawai Fusako, Oda Masayuki. Multiple structural states of Ca2+-regulated PET hydrolase, Cut190, and its correlation with activity and stability The Journal of Biochemistry. 2021.02; 169 (2): 207-213. ( 医中誌 )

  15. Alborzian Deh Sheikh A, Gomaa S, Li X, Routledge M, Saigoh K, Numoto N, Angata T, Hitomi Y, Takematsu H, Tsuiji M, Ito N, Kusunoki S, Tsubata T. A Guillain-Barré syndrome-associated SIGLEC10 rare variant impairs its recognition of gangliosides. Journal of autoimmunity. 2021.01; 116 102571. ( PubMed, DOI )

  16. Sasaki H, Masuno H, Kawasaki H, Yoshihara A, Numoto N, Ito N, Ishida H, Yamamoto K, Hirata N, Kanda Y, Kawachi E, Kagechika H, Tanatani A. Lithocholic Acid Derivatives as Potent Vitamin D Receptor Agonists. Journal of medicinal chemistry. 2020.12; 64 (1): 516-526. ( PubMed, DOI )

  17. Emori Miho, Numoto Nobutaka, Senga Akane, Bekker Gert-Jan, Kamiya Narutoshi, Kobayashi Yuma, Ito Nobutoshi, Kawai Fusako, Oda Masayuki. Structural basis of mutants of PET-degrading enzyme from Saccharomonospora viridis AHK190 with high activity and thermal stability PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS. 2020.12; 89 (5): 502-511. ( PubMed, DOI )

  18. Iiyama M, Numoto N, Ogawa S, Kuroda M, Morii H, Abe R, Ito N, Oda M. Molecular interactions of the CTLA-4 cytoplasmic region with the phosphoinositide 3-kinase SH2 domains. Molecular immunology. 2020.12; 131 51-59. ( PubMed, DOI )

  19. Senga A, Numoto N, Yamashita M, Iida A, Ito N, Kawai F, Oda M. Multiple structural states of Ca2+ regulated PET hydrolase, Cut190, and its correlation with activity and stability. Journal of biochemistry. 2020.09; 169 (2): 207-213. ( PubMed, DOI )

  20. Ikura Teikichi, Ito Nobutoshi. Pin1の変異体C113AとC113Sの構造解析(Structural analysis of Pin1 mutants C113A And C113S) 生物物理. 2020.08; 60 (Suppl.1-2): S144. ( 医中誌 )

  21. Nishiguchi A, Numoto N, Ito N, Azuma T, Oda M. Three-dimensional structure of a high affinity anti-(4-hydroxy-3-nitrophenyl)acetyl antibody possessing a glycine residue at position 95 of the heavy chain. Molecular immunology. 2019.10; 114 545-552. ( PubMed, DOI )

  22. Masuno Hiroyuki, Kazui Yuko, Tanatani Aya, Fujii Shinya, Kawachi Emiko, Ikura Teikichi, Ito Nobutoshi, Yamamoto Keiko, Kagechika Hiroyuki. Development of novel lithocholic acid derivatives as vitamin D receptor agonists BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY. 2019.08; 27 (16): 3674-3681. ( PubMed, DOI )

  23. Numoto Nobutaka, Fukumori Yoshihiro, Miki Kunio, Ito Nobutoshi. 巨大ヘモグロビンのアロステリック中間体の時分割構造解析(Time-resolved structure analysis of allosteric intermediate of the giant hemoglobin) 生物物理. 2019.08; 59 (Suppl.1-2): S245. ( 医中誌 )

  24. Yasukochi Shotaro, Numoto Nobutaka, Hori Kiminori, Tenno Natsuko, Tenno Takeshi, Ito Nobutoshi, Hiroaki Hidekazu. ヒトDishevelled1 PDZドメインと阻害剤の共結晶構造解析(Crystal structure of human Dishevelled1 PDZ with its inhibitor) 生物物理. 2019.08; 59 (Suppl.1-2): S240. ( 医中誌 )

  25. Nakayama S, Shimonaka S, Elahi M, Nishioka K, Oji Y, Matsumoto SE, Li Y, Yoshino H, Mogushi K, Hatano T, Sato T, Ikura T, Ito N, Motoi Y, Hattori N. Tau aggregation and seeding analyses of two novel MAPT variants found in patients with motor neuron disease and progressive parkinsonism. Neurobiology of aging. 2019.03; 84 240.e13-240.e22. ( PubMed, DOI )

  26. Yurina Miyashita, Nobutaka Numoto, Sundaram Arulmozhiraja, Shogo Nakano, Naoya Matsuo, Kanade Shimizu, Osamu Shibahara, Michiko Fujihara, Hiroki Kakuta, Sohei Ito, Teikichi Ikura, Nobutoshi Ito, Hiroaki Tokiwa. Dual conformation of the ligand induces the partial agonistic activity of retinoid X receptor α (RXRα). FEBS Lett.. 2019.01; 593 (2): 242-250. ( PubMed, DOI )

  27. Hosoe Y, Numoto N, Inaba S, Ogawa S, Morii H, Abe R, Ito N, Oda M. Structural and functional properties of Grb2 SH2 dimer in CD28 binding. Biophysics and physicobiology. 2019; 16 80-88. ( PubMed, DOI )

  28. Ikura T, Yonezawa Y, Ito N. Mutational effects of Cys113 on structural dynamics of Pin1. Biophysics and physicobiology. 2019; 16 452-465. ( PubMed, DOI )

  29. Nobutaka Numoto, Narutoshi Kamiya, Gert-Jan Bekker, Yuri Yamagami, Satomi Inaba, Kentaro Ishii, Susumu Uchiyama, Fusako Kawai, Nobutoshi Ito, Masayuki Oda. Structural Dynamics of the PET-Degrading Cutinase-like Enzyme from Saccharomonospora viridis AHK190 in Substrate-Bound States Elucidates the Ca2+-Driven Catalytic Cycle. Biochemistry. 2018.08; 57 (36): 5289-5300. ( PubMed, DOI )

  30. Teikichi Ikura, Naoya Tochio, Ryosuke Kawasaki, Mizuki Matsuzaki, Akihiro Narita, Mahito Kikumoto, Naoko Utsunomiya-Tate, Shin-Ichi Tate, Nobutoshi Ito. The trans isomer of Tau peptide is prone to aggregate, and the WW domain of Pin1 drastically decreases its aggregation. FEBS Lett.. 2018.08; 592 (18): 3082-3091. ( PubMed, DOI )

  31. Rocio Otero, Michiyasu Ishizawa, Nobutaka Numoto, Teikichi Ikura, Nobutoshi Ito, Hiroaki Tokiwa, Antonio Mouriño, Makoto Makishima, Sachiko Yamada. Synthesis, Tissue Selective Biological Activities, and X-ray Crystal Structural Analysis of Its Vitamin D Receptor Complex. J. Med. Chem.. 2018.08; 61 (15): 6658-6673. ( PubMed, DOI )

  32. Naoki Miyamoto, Miho Yoshimura, Yuji Okubo, Kayo Suzuki-Nagata, Takeshi Tsumuraya, Nobutoshi Ito, Ikuo Fujii. Structural basis of the broad substrate tolerance of the antibody 7B9-catalyzed hydrolysis of p-nitrobenzyl esters. Bioorg. Med. Chem.. 2018.05; 26 (8): 1412-1417. ( PubMed, DOI )

  33. Naoko Matsubara, Akihiro Imamura, Tatsuya Yonemizu, Chizuru Akatsu, Hongrui Yang, Akiharu Ueki, Natsuki Watanabe, Hajjaj Abdu-Allah, Nobutaka Numoto, Hiromu Takematsu, Shinobu Kitazume, Thomas F Tedder, Jamey D Marth, Nobutoshi Ito, Hiromune Ando, Hideharu Ishida, Makoto Kiso, Takeshi Tsubata. CD22-Binding Synthetic Sialosides Regulate B Lymphocyte Proliferation Through CD22 Ligand-Dependent and Independent Pathways, and Enhance Antibody Production in Mice. Front Immunol. 2018.04; 9 820. ( PubMed, DOI )

  34. Numoto Nobutaka, Akatsu Chizuru, Shinagawa Kenro, Tsubata Takeshi, Ito Nobutoshi. B細胞抑制性因子CD72の分子表面電荷分布によるリガンド結合制御機構(Charge distribution regulates the ligand-binding affinity of B cell inhibitory receptor CD72) 生物物理. 2017.08; 57 (Suppl.1-2): S276. ( 医中誌 )

  35. Ikura Teikichi, Ito Nobutoshi. タウタンパク質に対するPin1由来のプロテアーゼの活性の定量的評価(Quantitative evaluation of activity of a protease derived from Pin1 for tau protein) 生物物理. 2017.08; 57 (Suppl.1-2): S315. ( 医中誌 )

  36. Satomi Inaba, Nobutaka Numoto, Shuhei Ogawa, Hisayuki Morii, Teikichi Ikura, Ryo Abe, Nobutoshi Ito, Masayuki Oda. Crystal Structures and Thermodynamic Analysis Reveal Distinct Mechanisms of CD28 Phosphopeptide Binding to the Src Homology 2 (SH2) Domains of Three Adaptor Proteins. J. Biol. Chem.. 2017.01; 292 (3): 1052-1060. ( PubMed, DOI )

  37. Kulkarni Manjiri R., Islam Monirul, Numoto Nobutaka, Elahi Montasir, Ito Nobutoshi, Kuroda Yutaka. Crystallographic studies of sero-specific Dengue ED3 immune response ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES. 2017; 73 A404. ( DOI )

  38. Kulkarni Manjiri Ravindra, Islam Monirul, Numoto Nobutaka, Ito Nobutoshi, Kuroda Yutaka. Crystal structures of dengue virus protein revealed ED3 sero-specificity ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES. 2017; 73 C394. ( DOI )

  39. Chizuru Akatsu, Kenro Shinagawa, Nobutaka Numoto, Zhihong Liu, Ayse Konuskan Ucar, Mohammad Aslam, Shirly Phoon, Takahiro Adachi, Koji Furukawa, Nobutoshi Ito, Takeshi Tsubata. CD72 negatively regulates B lymphocyte responses to the lupus-related endogenous toll-like receptor 7 ligand Sm/RNP. J. Exp. Med.. 2016.11; 213 (12): 2691-2706. ( PubMed, DOI )

  40. Tomomi Imamura, Kyota Fujita, Kazuhiko Tagawa, Teikichi Ikura, Xigui Chen, Hidenori Homma, Takuya Tamura, Ying Mao, Juliana Bosso Taniguchi, Kazumi Motoki, Makoto Nakabayashi, Nobutoshi Ito, Kazunori Yamada, Kentaro Tomii, Hideyuki Okano, Julia Kaye, Steven Finkbeiner, Hitoshi Okazawa. Identification of hepta-histidine as a candidate drug for Huntington's disease by in silico-in vitro- in vivo-integrated screens of chemical libraries. Sci Rep. 2016.09; 6 33861. ( PubMed, DOI )

  41. Isao Kii, Yuto Sumida, Toshiyasu Goto, Rie Sonamoto, Yukiko Okuno, Suguru Yoshida, Tomoe Kato-Sumida, Yuka Koike, Minako Abe, Yosuke Nonaka, Teikichi Ikura, Nobutoshi Ito, Hiroshi Shibuya, Takamitsu Hosoya, Masatoshi Hagiwara. Selective inhibition of the kinase DYRK1A by targeting its folding process. Nature Communications. 2016.04; 7 11391. ( PubMed, DOI )

  42. Manjiri R Kulkarni, Nobutaka Numoto, Nobutoshi Ito, Yutaka Kuroda. Modeling and experimental assessment of a buried Leu-Ile mutation in dengue envelope domain III. Biochem. Biophys. Res. Commun.. 2016.02; 471 (1): 163-168. ( PubMed, DOI )

  43. Teikichi Ikura, Nobutoshi Ito. Crystal Structure of the Vitamin D Receptor Ligand-Binding Domain with Lithocholic Acids. Vitam. Horm.. 2016; 100 117-136. ( PubMed, DOI )

  44. Yusuke Watarai, Michiyasu Ishizawa, Teikichi Ikura, Flavia C M Zacconi, Shigeyuki Uno, Nobutoshi Ito, Antonio Mouriño, Hiroaki Tokiwa, Makoto Makishima, Sachiko Yamada. Synthesis, Biological Activities, and X-ray Crystal Structural Analysis of 25-Hydroxy-25(or 26)-adamantyl-17-[20(22),23-diynyl]-21-norvitamin D Compounds. J. Med. Chem.. 2015.12; 58 (24): 9510-9521. ( PubMed, DOI )

  45. Yasuaki Anami, Yuta Sakamaki, Toshimasa Itoh, Yuka Inaba, Makoto Nakabayashi, Teikichi Ikura, Nobutoshi Ito, Keiko Yamamoto. Fine tuning of agonistic/antagonistic activity for vitamin D receptor by 22-alkyl chain length of ligands: 22S-Hexyl compound unexpectedly restored agonistic activity. Bioorg. Med. Chem.. 2015.11; 23 (22): 7274-7281. ( PubMed, DOI )

  46. Manjiri R Kulkarni, Monirul M Islam, Nobutaka Numoto, Montasir Elahi, Mamunur R Mahib, Nobutoshi Ito, Yutaka Kuroda. Structural and biophysical analysis of sero-specific immune responses using epitope grafted Dengue ED3 mutants. Biochim. Biophys. Acta. 2015.10; 1854 (10 Pt A): 1438-1443. ( PubMed, DOI )

  47. So Masaki, Isao Kii, Yuto Sumida, Tomoe Kato-Sumida, Yasushi Ogawa, Nobutoshi Ito, Mitsuhiro Nakamura, Rie Sonamoto, Naoyuki Kataoka, Takamitsu Hosoya, Masatoshi Hagiwara. Design and synthesis of a potent inhibitor of class 1 DYRK kinases as a suppressor of adipogenesis. Bioorg. Med. Chem.. 2015.08; 23 (15): 4434-4441. ( PubMed, DOI )

  48. Satoshi Morooka, Mitsuteru Hoshina, Isao Kii, Takayoshi Okabe, Hirotatsu Kojima, Naoko Inoue, Yukiko Okuno, Masatsugu Denawa, Suguru Yoshida, Junichi Fukuhara, Kensuke Ninomiya, Teikichi Ikura, Toshio Furuya, Tetsuo Nagano, Kousuke Noda, Susumu Ishida, Takamitsu Hosoya, Nobutoshi Ito, Nagahisa Yoshimura, Masatoshi Hagiwara. Identification of a Dual Inhibitor of SRPK1 and CK2 That Attenuates Pathological Angiogenesis of Macular Degeneration in Mice. Mol. Pharmacol.. 2015.08; 88 (2): 316-325. ( PubMed, DOI )

  49. Yamamoto Makoto, Onogi Hiroshi, Kii Isao, Yoshida Suguru, Iida Kei, Sakai Hiroyuki, Abe Minako, Tsubota Toshiaki, Ito Nobutoshi, Hosoya Takamitsu, Hagiwara Masatoshi. CDK9 inhibitor FIT-039 prevents replication of multiple DNA viruses. J Clin Invest. 2014.08; 124 (8): 3479-3488. ( PubMed, DOI )

  50. Kudo Takeru, Ishizawa Michiyasu, Maekawa Kazuki, Nakabayashi Makoto, Watarai Yusuke, Uchida Hikaru, Tokiwa Hiroaki, Ikura Teikichi, Ito Nobutoshi, Makishima Makoto, Yamada Sachiko. Combination of triple bond and adamantane ring on the vitamin D side chain produced partial agonists for vitamin D receptor. J Med Chem. 2014.05; 57 (10): 4073-4087. ( PubMed, DOI )

  51. Ikura Teikichi, Ito Nobutoshi. Peptidyl-prolyl isomerase activity of FK506 binding protein 12 prevents tau peptide from aggregating. Protein Eng Des Sel. 2013.09; 26 (9): 539-546. ( PubMed, DOI )

  52. Nakabayashi Makoto, Tsukahara Yoshito, Iwasaki-Miyamoto Yukiko, Mihori-Shimazaki Mika, Yamada Sachiko, Inaba Satomi, Oda Masayuki, Shimizu Masato, Makishima Makoto, Tokiwa Hiroaki, Ikura Teikichi, Ito Nobutoshi. Crystal structures of hereditary vitamin D-resistant rickets-associated vitamin D receptor mutants R270L and W282R bound to 1,25-dihydroxyvitamin D3 and synthetic ligands. J Med Chem. 2013.09; 56 (17): 6745-6760. ( PubMed, DOI )

  53. Masuno Hiroyuki, Ikura Teikichi, Morizono Daisuke, Orita Isamu, Yamada Sachiko, Shimizu Masato, Ito Nobutoshi. Crystal structures of complexes of vitamin D receptor ligand-binding domain with lithocholic acid derivatives. J Lipid Res. 2013.08; 54 (8): 2206-2213. ( PubMed, DOI )

  54. Higo K, Ikura T, Oda M, Morii H, Takahashi J, Abe R, Ito N. High resolution crystal structure of the Grb2 SH2 domain with a phosphopeptide derived from CD28 PLoS One. 2013.08; 8 (9): e74482. ( DOI )

  55. Higo Kunitake, Ikura Teikichi, Oda Masayuki, Morii Hisayuki, Takahashi Jun, Abe Ryo, Ito Nobutoshi. High resolution crystal structure of the Grb2 SH2 domain with a phosphopeptide derived from CD28. PLoS One. 2013; 8 (9): e74482. ( PubMed, DOI )

  56. Yoshimoto Nobuko, Sakamaki Yuta, Haeta Minoru, Kato Akira, Inaba Yuka, Itoh Toshimasa, Nakabayashi Makoto, Ito Nobutoshi, Yamamoto Keiko. Butyl pocket formation in the vitamin D receptor strongly affects the agonistic or antagonistic behavior of ligands. J Med Chem. 2012.05; 55 (9): 4373-4381. ( PubMed, DOI )

  57. Nomura Wataru, Masuda Akemi, Ohba Kenji, Urabe Arisa, Ito Nobutoshi, Ryo Akihide, Yamamoto Naoki, Tamamura Hirokazu. Effects of DNA binding of the zinc finger and linkers for domain fusion on the catalytic activity of sequence-specific chimeric recombinases determined by a facile fluorescent system. Biochemistry. 2012.02; 51 (7): 1510-1517. ( PubMed, DOI )

  58. Tamashiro Tomonari, Tanabe Yoichi, Ikura Teikichi, Ito Nobutoshi, Oda Masayuki. Critical roles of Asp270 and Trp273 in the alpha-repeat of the carbohydrate-binding module of endo-1,3-beta-glucanase for laminarin-binding avidity. Glycoconj J. 2012.01; 29 (1): 77-85. ( PubMed, DOI )

  59. Fujii Shinya, Masuno Hiroyuki, Taoda Yoshiyuki, Kano Atsushi, Wongmayura Angsuma, Nakabayashi Makoto, Ito Nobutoshi, Shimizu Masato, Kawachi Emiko, Hirano Tomoya, Endo Yasuyuki, Tanatani Aya, Kagechika Hiroyuki. Boron cluster-based development of potent nonsecosteroidal vitamin D receptor ligands: direct observation of hydrophobic interaction between protein surface and carborane. J Am Chem Soc. 2011.12; 133 (51): 20933-20941. ( PubMed, DOI )

  60. Nomura Wataru, Ohashi Nami, Okuda Yoshiaki, Narumi Tetsuo, Ikura Teikichi, Ito Nobutoshi, Tamamura Hirokazu. Fluorescence-quenching screening of protein kinase C ligands with an environmentally sensitive fluorophore. Bioconjug Chem. 2011.05; 22 (5): 923-930. ( PubMed, DOI )

  61. Inaba Yuka, Nakabayashi Makoto, Itoh Toshimasa, Yoshimoto Nobuko, Ikura Teikichi, Ito Nobutoshi, Shimizu Masato, Yamamoto Keiko. 22S-butyl-1alpha,24R-dihydroxyvitamin D3: recovery of vitamin D receptor agonistic activity. J Steroid Biochem Mol Biol. 2010.07; 121 (1-2): 146-150. ( PubMed, DOI )

  62. Ogawa Yasushi, Nonaka Yosuke, Goto Toshiyasu, Ohnishi Eriko, Hiramatsu Toshiyuki, Kii Isao, Yoshida Miyo, Ikura Teikichi, Onogi Hiroshi, Shibuya Hiroshi, Hosoya Takamitsu, Ito Nobutoshi, Hagiwara Masatoshi. Development of a novel selective inhibitor of the Down syndrome-related kinase Dyrk1A. Nat Commun. 2010; 1 86. ( PubMed, DOI )

  63. Inaba Yuka, Yoshimoto Nobuko, Sakamaki Yuta, Nakabayashi Makoto, Ikura Teikichi, Tamamura Hirokazu, Ito Nobutoshi, Shimizu Masato, Yamamoto Keiko. A new class of vitamin D analogues that induce structural rearrangement of the ligand-binding pocket of the receptor. J Med Chem. 2009.03; 52 (5): 1438-1449. ( PubMed, DOI )

  64. Nakabayashi Makoto, Yamada Sachiko, Yoshimoto Nobuko, Tanaka Takashi, Igarashi Miharu, Ikura Teikichi, Ito Nobutoshi, Makishima Makoto, Tokiwa Hiroaki, DeLuca Hector F, Shimizu Masato. Crystal structures of rat vitamin D receptor bound to adamantyl vitamin D analogs: structural basis for vitamin D receptor antagonism and partial agonism. J Med Chem. 2008.09; 51 (17): 5320-5329. ( PubMed, DOI )

  65. Shimizu Masato, Miyamoto Yukiko, Takaku Hajime, Matsuo Mayumi, Nakabayashi Makoto, Masuno Hiroyuki, Udagawa Nobuyuki, DeLuca Hector F, Ikura Teikichi, Ito Nobutoshi. 2-Substituted-16-ene-22-thia-1alpha,25-dihydroxy-26,27-dimethyl-19-norvitamin D3 analogs: Synthesis, biological evaluation, and crystal structure. Bioorg Med Chem. 2008.07; 16 (14): 6949-6964. ( PubMed, DOI )

  66. Urakubo Yoshiaki, Ikura Teikichi, Ito Nobutoshi. Crystal structural analysis of protein-protein interactions drastically destabilized by a single mutation. Protein Sci. 2008.06; 17 (6): 1055-1065. ( PubMed, DOI )

  67. Ikura Teikichi, Kinoshita Kengo, Ito Nobutoshi. A cavity with an appropriate size is the basis of the PPIase activity. Protein Eng Des Sel. 2008.02; 21 (2): 83-89. ( PubMed, DOI )

  68. Ikura Teikichi, Ito Nobutoshi. Requirements for peptidyl-prolyl isomerization activity: a comprehensive mutational analysis of the substrate-binding cavity of FK506-binding protein 12. Protein Sci. 2007.12; 16 (12): 2618-2625. ( PubMed, DOI )

  69. Oda Masayuki, Ito Nobutoshi, Tsumuraya Takeshi, Suzuki Kayo, Sakakura Masayoshi, Fujii Ikuo. Thermodynamic and structural basis for transition-state stabilization in antibody-catalyzed hydrolysis. J Mol Biol. 2007.05; 369 (1): 198-209. ( PubMed, DOI )

  70. Tsuchiya Yuko, Kinoshita Kengo, Ito Nobutoshi, Nakamura Haruki. PreBI: prediction of biological interfaces of proteins in crystals. Nucleic Acids Res. 2006.07; 34 (Web Server issue): W320-W324. ( PubMed, DOI )

  71. Westbrook John, Ito Nobutoshi, Nakamura Haruki, Henrick Kim, Berman Helen M. PDBML: the representation of archival macromolecular structure data in XML. Bioinformatics. 2005.04; 21 (7): 988-992. ( PubMed, DOI )

  72. Higo J, Ito N, Kuroda M, Ono S, Nakajima N, Nakamura H. Energy landscape of a peptide consisting of alpha-helix, 3(10)-helix, beta-turn, beta-hairpin, and other disordered conformations. Protein Sci. 2001.06; 10 (6): 1160-1171. ( PubMed, DOI )

  73. Otomo T, Ito N, Kyogoku Y, Yamazaki T. NMR observation of selected segments in a larger protein: Central-segment isotope labeling through intein-mediated ligation BIOCHEMISTRY. 1999.12; 38 (49): 16040-16044. ( DOI )

  74. Yamazaki T, Otomo T, Oda N, Kyogoku Y, Uegaki K, Ito N, Ishino Y, Nakamura H. Segmental isotope labeling for protein NMR using peptide splicing JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 1998.06; 120 (22): 5591-5592. ( DOI )

  75. ITO N, KOMIYAMA NH, FERMI G. STRUCTURE OF DEOXYHEMOGLOBIN OF THE ANTARCTIC FISH PAGOTHENIA-BERNACCHII WITH AN ANALYSIS OF THE STRUCTURAL BASIS OF THE ROOT EFFECT BY COMPARISON OF THE LIGANDED AND UNLIGANDED HEMOGLOBIN STRUCTURES JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY. 1995.07; 250 (5): 648-658. ( DOI )

  76. NAGAI K, OUBRIDGE C, ITO N, AVIS J, EVANS P. THE RNP DOMAIN - A SEQUENCE-SPECIFIC RNA-BINDING DOMAIN INVOLVED IN PROCESSING AND TRANSPORT OF RNA TRENDS IN BIOCHEMICAL SCIENCES. 1995.06; 20 (6): 235-240. ( DOI )

  77. PRICE SR, ITO N, OUBRIDGE C, AVIS JM, NAGAI K. CRYSTALLIZATION OF RNA-PROTEIN COMPLEXES .1. METHODS FOR THE LARGE-SCALE PREPARATION OF RNA SUITABLE FOR CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY. 1995.06; 249 (2): 398-408. ( DOI )

  78. OUBRIDGE C, ITO N, TEO CH, FEARNLEY I, NAGAI K. CRYSTALLIZATION OF RNA-PROTEIN COMPLEXES .2. THE APPLICATION OF PROTEIN ENGINEERING FOR CRYSTALLIZATION OF THE U1A PROTEIN-RNA COMPLEX JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY. 1995.06; 249 (2): 409-423. ( DOI )

  79. Nagai K, Oubridge C, Ito N, Jessen T H, Avis J, Evans P. Crystal structure of the U1A spliceosomal protein complexed with its cognate RNA hairpin. Nucleic Acids Symp Ser. 1995; (34): 1-2. ( PubMed )

  80. Ito N, Knowles P F, Phillips S E. X-ray crystallographic studies of cofactors in galactose oxidase. Methods Enzymol. 1995; 258 235-262. ( PubMed )

  81. Oubridge C, Ito N, Evans P R, Teo C H, Nagai K. Crystal structure at 1.92 A resolution of the RNA-binding domain of the U1A spliceosomal protein complexed with an RNA hairpin. Nature. 1994.12; 372 (6505): 432-438. ( PubMed, DOI )

  82. Ito N, Phillips S E, Yadav K D, Knowles P F. Crystal structure of a free radical enzyme, galactose oxidase. J Mol Biol. 1994.05; 238 (5): 794-814. ( PubMed )

  83. McPherson M J, Stevens C, Baron A J, Ogel Z B, Seneviratne K, Wilmot C, Ito N, Brocklebank I, Phillips S E, Knowles P F. Galactose oxidase: molecular analysis and mutagenesis studies. Biochem Soc Trans. 1993.08; 21 ( Pt 3) (3): 752-756. ( PubMed )

  84. Evans P R, Oubridge C, Jessen T H, Li J, Teo C H, Pritchard C, Ito N, Nagai K. Model of the interaction between the UI A small nuclear ribonucleoprotein and UI small nuclear RNA stem/loop II. Biochem Soc Trans. 1993.08; 21 ( Pt 3) (3): 605-609. ( PubMed )

  85. Ito N, Phillips S E, Stevens C, Ogel Z B, McPherson M J, Keen J N, Yadav K D, Knowles P F. Three-dimensional structure of galactose oxidase: an enzyme with a built-in secondary cofactor. Faraday Discuss. 1992; (93): 75-84. ( PubMed )

  86. Ito N, Phillips S E, Stevens C, Ogel Z B, McPherson M J, Keen J N, Yadav K D, Knowles P F. Novel thioether bond revealed by a 1.7 A crystal structure of galactose oxidase. Nature. 1991.03; 350 (6313): 87-90. ( PubMed, DOI )

  87. ITO N, NAKAMURA H, SUMIKAWA H, NAGASHIMA N, ARATA Y, NISHIMURA Y. STRUCTURE OF A DNA OCTAMER, D(CCTTAAGG)2 OBTAINED BY RESTRAINED MOLECULAR-DYNAMICS BASED ON RAMAN AND NMR DATA JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE. 1991.01; 242 119-133. ( DOI )

  88. Ito N, Keen J N, Knowles P F, McPherson M J, Phillips S E, Stevens C, Yadav K D. Structural analysis of galactose oxidase. Biochem Soc Trans. 1990.10; 18 (5): 931-932. ( PubMed )

  89. Numoto Nobutaka, Kawano Yoshiaki, Okumura Hideo, Baba Seiki, Fukumori Yoshihiro, Miki Kunio, Ito Nobutoshi. Coarse snapshots of oxygen-dissociation intermediates of a giant hemoglobin elucidated by determining the oxygen saturation in individual subunits in the crystalline state IUCRJ. 2021.11; 8 (Pt 6): 954-962. ( PubMed, DOI )

  90. Numoto N., Hirata K., Akatsu C., Tsubata T., Ito N.. Molecular mechanism of self-antigen recognition by the ligand binding domain of B cell inhibitory co-receptor CD72 ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES. 2021.08; 77 C526.

  91. 棚谷 綾, 吉岡 千咲, 増野 弘幸, 森 修一, 伊藤 暢聡, 影近 弘之, 平田 尚也, 諫田 泰成. リトコール酸をリードとしたビタミンD誘導体の構造展開 ビタミン. 2021.03; 95 (3): 100-101. ( 医中誌 )

  92. 吉原 綾菜, 吉岡 千咲, 川崎 波留, 増野 弘幸, 河内 恵美子, 諫田 泰成, 平田 尚也, 伊藤 暢聡, 影近 弘之, 棚谷 綾. 高いビタミンD活性を有するリトコール酸側鎖誘導体の創製 ビタミン. 2020.04; 94 (4): 287. ( 医中誌 )

  93. 棚谷 綾, 吉岡 千咲, 川崎 波留, 佐々木 晴江, 藤原 葉子, 増野 弘幸, 伊藤 暢聡, 影近 弘之. ビタミンD活性を有するリトコール酸誘導体の構造展開 ビタミン. 2019.08; 93 (8): 370-371. ( 医中誌 )

  94. 沼本 修孝, 赤津 ちづる, 品川 健朗, 鍔田 武志, 伊藤 暢聡. B細胞抑制性因子CD72とSm/RNPの複合体形成様式の推測 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集. 2018.09; 91回 [1P-084]. ( 医中誌 )

  95. 細江 雄飛, 稲葉 理美, 沼本 修孝, 伊藤 暢聡, 織田 昌幸. SH2ドメインスワップダイマーが与える安定性と機能への影響評価 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集. 2018.09; 91回 [1T11e-04(1P. ( 医中誌 )

  96. 石澤 通康, Otero Rocio, 沼本 修孝, 伊倉 貞吉, 伊藤 暢聡, 常盤 広明, Mourino Antonio, 槇島 誠, 山田 幸子. 25-Adamantyl-1α、25-dihydroxyvitamin D3誘導体の組織選択的活性 ビタミン. 2018.04; 92 (4): 232. ( 医中誌 )

  97. Ikura T., Ito N.. Functional conversion from peptydyl-prolyl isomerase to protease by a single amino acid substitution EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS. 2017.07; 46 S162.

  98. 棚谷 綾, 佐々木 晴江, 川崎 波留, 増野 弘幸, 河内 恵美子, 伊藤 暢聡, 石田 寛明, 山本 恵子, 平野 真梨子, 影近 弘之. 高いビタミンD活性を有するリトコール酸誘導体の創製 ビタミン. 2017.04; 91 (4): 301. ( 医中誌 )

  99. Ikura Teikichi, Kinoshita Kengo, Ito Nobutoshi. [Correlation between structure and function of peptidyl-prolyl isomerase]. Tanpakushitsu Kakusan Koso. 2009.02; 54 (2): 167-172. ( PubMed )

  100. Nakamura Haruki, Ito Nobutoshi, Kusunoki Masami. [Development of PDBj: Advanced database for protein structures]. Tanpakushitsu Kakusan Koso. 2002.06; 47 (8 Suppl): 1097-1101. ( PubMed )

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講演・口頭発表等 【 表示 / 非表示

  1. Hansaka N. Thilakarathne N. M., Takashi Misawa, Yosuke Demizu, Yuya Hanazono, Nobutoshi Ito, Hiroyuki Kagechika, Shinya Fujii. Structure-activity relationship (SAR) study of hydrophobic moiety of nonsecosteroidal VDR ligands using diphenylsilane scaffold. 21st IUPAB Congress 2024 2024.06.25

  2. Gamage Hashadi Nadeesha Walakulu, Sheikh Amin Alborzian Deh, Ito Nobutoshi, Asano Masatake, Tsubata Takeshi. LFA-1はCD22のシアル酸を介した新規シスリガンドでありB細胞の活性化と接着を制御している(LFA-1 is a novel sialic acid-mediated cis-ligand of CD22 that regulates B cell activation and adhesion). 日本免疫学会総会・学術集会記録 2023.12.01

  3. Tsuneshige Takahiro, Akatsu Chiuru, Sekine Hideharu, Ito Nobutoshi, Tsubata Takeshi. SLEでのアポトーシス細胞に対するB細胞応答の制御におけるCD72とC1qの相互作用の役割(Role of the interaction of CD72 with C1q in the regulation of B cell responses to apoptotic cells in SLE). 日本免疫学会総会・学術集会記録 2023.12.01

  4. Yuya Hanazono, Yu Hirano, Nobutoshi Ito, Taro Tamada, Kunio Miki. Fine structure analysis of protein: Unraveling molecular details through ultra-high-resolution X-ray and neutron crystallography. 18th International Symposium of The Institute Network 2023.10.06

  5. Xibin Quan, Nobutaka Numoto, Takeshi Tsubata, Nobutoshi Ito. Structure and function analysis of human B cell inhibitory co-receptor CD72. The 23rd Annual Meeting of the Protein Science Society of Japan 2023.07.06

  6. Xibin Quan, Nobutaka Numoto, Takeshi Tsubata, Nobutoshi Ito. Structure analysis of human B cell inhibitory co-receptor CD72. The 60th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan 2022.09.28 Hakodate

  7. Nobutaka Numoto, Kunio Hirata, Chizuru Akatsu, Takeshi Tsubata, Nobutoshi Ito. Molecular mechanism of self-antigen recognition by the ligand binding domain of B cell inhibitory co-receptor CD72. 25th Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography 2021.08.20 Prague / on-line hybrid meeting

  8. Alborzian Deh Sheikh A., Li X., Gomaa S., Routledge M., Numoto N., Ito N., Kusunoki S., Tsubata T.. Guillain-Barré syndrome-associated SIGLEC10 rare variant impairs its recognition of gangliosides. 第85回日本インターフェロン・サイトカイン学会学術集会 2021.05.21

  9. Nobutoshi Ito. PDBx/mmCIF format for crystallographic deposition to the Protein Data Bank (PDB). Annual Meeting of The Federation of Korean Societies for Molecular & Biomedical Sciences (FKSBS) 2020.01.10 Gwangju, South Korea

  10. Daisuke Imai, Nobutaka Numoto, Sundaram Arulmozhiraja, Shogo Masuda, Hiroki Kakuta, Hiroaki Tokiwa, Nobutoshi Ito. Structural analysis of NEt-3IB/NEt-4IB-bound Retinoid X Receptor α. 16th Conference of the Asian Crystallographic Association 2019.12.18 Singapore

  11. Teikichi Ikura, Nobutoshi Ito. Micronization of a protease derived from Pin1. The 57th annual meeting of the Biophysical Society of Japan 2019.09.25

  12. 沼本修孝, 福森義, 三木邦夫, 伊藤暢聡. 巨大ヘモグロビンのアロステリック中間体における酸素占有率のサブユニットごとの推移. 第19回日本蛋白質科学会年会第71回日本細胞生物学会大会合同年次大会 2019.06.24 神戸

  13. Teikichi Ikura and Nobutoshi Ito. Mutational analysis on the catalytic site of a protease derived from Pin1. The 56th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan 2018.09.15

  14. Yurina Miyashita, Nobutaka Numoto, Sundaram Arulmozhiraja, Shogo Nakano, Naoya Matsuo, Kanade Shimizu, Osamu Shibahara, Michiko Fujiwara, Hiroki Kakuta, Sohei Ito, Teikichi Ikura, Nobutoshi Ito, Hiroaki Tokiwa. Crystal structure of the tetrameric ligand binding domain of RXRalpha complexed with a novel synthetic partial agonist. The 56th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan 2018.09.15

  15. 沼本修孝, 山上由莉, 稲葉理美, 河合富佐子, 織田昌幸, 伊藤暢聡. ポリエチレンテレフタラート加水分解酵素Cut190基質複合体の結晶構造. 第18回日本蛋白質科学会年会 2018.06.27 新潟

  16. Kanade Shimizu, Yurina Miyashita, Yuta Yamamoto, Naoya Matsuo, Shogo Nakano, Sohei Ito, Nobutaka Numoto, Nobutoshi Ito, Hiroki Kakuta, Hiroaki Tokiwa. What is the origin of partial agonist activity of CBt-PMN for hRXRα?. Experimental biology 2018 2018.04.24 USA

  17. Yurina Miyashita, Naoya Matsuo, Yuta Yamamoto, Shogo Nakano, Sohei Ito, Nobutaka Numoto, Teikichi Ikura, Nobutoshi Ito, Motohiro Sekiya, Hitoshi Shimano, and Hiroaki Tokiwa. Computational design and molecular mechanism in oligomerization of C-terminal binding protein 2. Experimental biology 2018 2018.04.24 USA

  18. Haru Kawasaki, Harue Sasaki, Hiroyuki Masuno, Emiko Kawachi, Nobutoshi Ito, Hiroyuki Kagechika, Aya Tanatani. Development of Lithocholic Acid Derivatives with A 3-Hydroxyalky Group as Novel Nonsecosteroidal Vitamin D Analogs. Symposium on Frontier of Genomic Medicine ‘Retinoid (Am80, Tamibarotene) as therapeutics for intractable diseases’ 2018.01.29 東京

  19. Teikichi Ikura, Nobutoshi Ito. Quantitative evaluation of activity of a protease derived from Pin1 for tau protein. The 56th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan 2017.09.21 Kumamoto, Japan

  20. Teikichi Ikura, Nobutoshi Ito. Functional conversion from peptidyl-prolyl isomerase to protease by a single amino acid substitution. the joint 19th International Union of Pure and Applied Biophysics 2017.07.17 Edinburgh, UK

  21. 伊倉貞吉, 伊藤暢聡. Pin1由来のタンパク質分解酵素の触媒機構. 第17回日本蛋白質科学会年会 2017.06.21 仙台市

  22. Nobutoshi Ito. Protein Data Bank and Structure Deposition at PDBj. CCP4 Crystallography School and Workshop 2017.01.27 SPring8, Harima, Japan

  23. Nobutoshi Ito. Influences of drug binding to protein structure and flexibility. 第15回駿河台シンポジウム 2016.11.29

  24. Teikichi Ikura, Nobutoshi Ito. Activity of a protease derived from Pin1 for tau protein. The 54th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan 2016.11.26 Tsukuba

  25. Satomi Inaba, Nobutaka Numoto, Shuhei Ogawa, Hisayuki Morii, Teikichi Ikura, Ryo Abe, Nobutoshi Ito, Masayuki Oda. Structural and thermodynamic analysis of interactions between CD28 and SH2 domains. The 54th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan 2016.11.25 Tsukuba

  26. 沼本修孝, 中川太郎, 伊藤暢聡, 福森義宏, 三木邦夫. 巨大ヘモグロビン酸素解離中間体のX線結晶構造と分光学的解析. 第54回日本生物物理学会年会 2016.11 茨城

  27. Nobutoshi Ito. Protein Data Bank and Structure Deposition at PDBj. OIST-CCP4 Workshop 2015.11 Okinawa, Japan

  28. Inaba S., Numoto N., Morii H., Ikura T., Abe R., Ito N., Oda M.. Structural and thermodynamic analysis of co-stimulation receptor CD28 phosphopeptide interactions with Grb2, Gads, and PI3-kinese SH2 domains. The 29th Annual Symposium of The Protein Society 2015.07 Palau de Congressos de Barcelona, Barcelona (Spain)

  29. Nobutaka Numoto, Taro Nakagawa, Akiko Kita, Nobutoshi Ito, Yoshihiro Fukumori,Kunio Miki. Partial oxygen-dissociation of crystalline giant hemoglobin. Twenty-Third Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography 2014.08 Montreal (Canada)

  30. 安藤夏乃, 天野剛志, 濱嶋竜生, 高木春樺, 花園祐矢, 沼本修孝, 伊藤暢聡, 廣明秀一. 抗コロナウイルス薬の開発を志向したPDZドメイン阻害剤の探索. 第24回日本蛋白質科学会年会 2024.06.12

  31. Purnima Liyanage, Nobutaka Numoto, Yuya Hanazono, Takeshi Tsubata, Nobutoshi Ito. Crystal structure of B lymphocyte associated co-receptor human CD72-CTLD. 第24回日本蛋白質科学会年会 2024.06.11

  32. Hansaka N. Thilakarathne N. M., Takashi Misawa, Yosuke Demizu, Yuya Hanazono, Nobutoshi Ito, Hiroyuki Kagechika, Shinya Fujii. Structure-activity relationship (SAR) study of hydrophobic moiety of nonsecosteroidal VDR ligands using diphenylsilane scaffold. 第24回日本蛋白質科学会年会 2024.06.11

  33. Thilakarathne N.M. Hansaka N., 影近 弘之, 藤井 晋也, 花園 祐矢, 伊藤 暢聡, 三澤 隆史, 出水 庸介. ジフェニルシラン構造を基盤としたVDRリガンドの疎水性部位の構造展開と結合様式の解析. 生体医歯工学共同研究拠点成果報告書 2024.04.01

  34. Hansaka N. Thilakarathne N. M., Takashi Misawa, Yosuke Demizu, Yuya Hanazono, Nobutoshi Ito, Hiroyuki Kagechika, Shinya Fujii. Structure-activity relationship (SAR) study of hydrophobic moiety of nonsecosteroidal VDR ligands using diphenylsilane scaffold. 日本薬学会第144回年会 2024.03.29

  35. 藪野沙彩,沼本修孝,伊藤暢聡,東隆親,織田昌幸. 抗ニトロフェニル(NP)抗体の親和性成熟と安定性低下のトレードオフ ~変異体を用いた要因解析~. 第2回日本抗体学会学術大会 2023.12.02

  36. Mutsumi Yoshida, Yumi Kitagawa, Masayuki Oda, Nobutaka Numoto, Nobutoshi Ito. 重鎖CDR3ループ内ジスルフィド結合が抗原結合や安定性に与える影響. 第61回日本生物物理学会年会 2023.11.14 名古屋

  37. 沼本修孝, Gert-Jan Bekker, 神谷成敏, 織田昌幸, 伊藤暢聡. PET分解酵素Cut190のアロステリック反応機構に基づく機能向上変異体の合理的設計. 第23回日本蛋白質科学会年会 2023.07.07

  38. Thilakarathne N.M.Hansaka N., Kagechika Hiroyuki, Fujii Shinya, Ito Nobutoshi, Misawa Takashi, Demizu Yosuke. Diphenylsilaneスキャフォールドを用いた非セコステロイド性VDRリガンドの開発 疎水性コア構造の構造-活性相関. 生体医歯工学共同研究拠点成果報告書 2023.04.01

  39. 沼本修孝, Gert-Jan Bekker, 神谷成敏, 織田昌幸,伊藤暢聡. PET分解酵素Cut190の基質アナログ結合型構造が明らかにする酵素反応サイクル. 令和4年度日本結晶学会年会 2022.11.26

  40. 沼本修孝, 全熙斌, 鍔田武志, 伊藤暢聡. B細胞抑制性共受容体CD72のリガンド認識の分子機構. 第95回日本生化学会大会 2022.11.11

  41. 安河内 章太郎, 沼本 修孝, 神谷 結葵, 日比野 絵美, 堀 公法, 合田 名都子, 天野 剛志, 伊藤 暢聡, 廣明 秀一. ヒトDvl1-PDZドメインと非ペプチド性阻害剤複合体の構造情報に基づく新規Wntシグナル阻害剤の分子設計. 日本薬学会年会要旨集 2022.03.25 札幌

  42. 沼本修孝, 飯山桃樺, 古林直樹, 伊中浩治, 織田昌幸, 伊藤暢聡. PI3K p85 SH2ドメインによるCTLA-4ペプチド認識機構. 日本結晶学会令和3年度年会 2021.11.19

  43. 飯山桃樺, 沼本修孝, 伊藤暢聡, 織田昌幸. 細胞内シグナル伝達タンパク質 PI3K cSH2のCys変異による物性及び受容体結合能への影響評価. 第94回日本生化学会大会 2021.11.03

  44. 飯山桃樺, 沼本修孝, 伊藤暢聡, 織田昌幸. 細胞内シグナル伝達タンパク質PI3K SH2 の結晶構造と熱力学特性. 第57回熱測定討論会 2021.10.29

  45. 沼本修孝, 平田邦生, 鍔田武志, 伊藤暢聡. B細胞抑制因子CD72のクラスター結晶からの構造決定. 日本結晶学会令和2年度年会 2020.11.27

  46. 飯山桃樺, 沼本修孝, 伊藤暢聡, 織田昌幸. 細胞内シグナル伝達タンパク質PI3K SH2の構造機能物性解析. 第56回熱測定討論会 2020.10.26

  47. 恵守未歩, 千賀明香音, 沼本修孝, 伊藤暢聡, 河合富佐子, 織田昌幸. PET分解酵素Cut190高機能化変異体の機能・構造解析. 第93回日本生化学会大会 2020.09.15

  48. 飯山桃樺, 沼本修孝, 伊藤暢聡, 織田昌幸. T細胞受容体CTLA-4とアダプター分子PI3K SH2との分子間相互作用解析. 第93回日本生化学会大会 2020.09.15

  49. 沼本修孝, 鍔田武志, 伊藤暢聡. B細胞抑制性因子の自己免疫疾患感受性アリルCD72cの結晶構造解析. 第20回日本蛋白質科学会年会 2020.07.15

  50. 吉原 彩菜, 川崎 波留, 増野 弘幸, 河内 恵美子, 諫田 泰成, 平田 尚也, 伊藤 暢聡, 影近 弘之, 棚谷 綾 . ビタミンD活性を有するリトコール酸アミド誘導体の構造展開. 日本薬学会 第140年会 2020.03.25

  51. 沼本修孝, 福森義宏, 三木邦夫, 伊藤暢聡. 巨大ヘモグロビンのアロステリック構造変化. 日本結晶学会令和元年度年会 2019.11.20 金沢

  52. 安河内 章太郎, 沼本 修孝, 堀 公法, 天野 名都子, 天野 剛志, 伊藤 暢聡, 廣明 秀一. Crystal structure of human Dishevelled1 PDZ with its inhibitor. 第57回日本生物物理学会年会 2019.09.24 宮崎

  53. 沼本 修孝, 福森 義宏, 三木 邦夫, 伊藤 暢聡. 巨大ヘモグロビンのアロステリック中間体の時分割構造解析. 第57回日本生物物理学会年会 2019.09.24 宮崎

  54. 西口明宏, 沼本修孝, 伊藤暢聡, 東隆親, 織田昌幸. 抗ニトロフェニル抗体の親和性成熟型一本鎖Fv抗体の抗原認識機構. 第92回日本生化学会大会 2019.09.18 横浜

  55. 西口 明宏, 沼本 修孝, 伊藤 暢聡, 東 隆親, 織田 昌幸. 抗ニトロフェニル抗体の親和性成熟型一本鎖Fv抗体の抗原認識機構. 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 2019.09.01

  56. 伊倉貞吉, 米澤康滋, 伊藤暢聡. プロリン異性化酵素Pin1の1残基変異C113Aに伴うダイナミクスの劇的変化. 第19回日本蛋白質科学会年会・第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会 2019.06.25 神戸市

  57. 西口明宏,沼本修孝,伊藤暢聡,東隆親,織田昌幸. 抗ニトロフェニル抗体の親和性成熟過程における抗原認識変化の構造基盤. 日本農芸化学会関西支部第508回講演会 2019.06.01 京都

  58. 吉岡千咲、川崎波留、佐々木晴江、増野弘幸、河内恵美子、伊藤暢聡、影近弘之、棚谷綾. ビタミンD活性を有するリトコール酸アミド誘導体の創製. 日本薬学会第139年会 2019.03.20 東京

  59. 安河内章太郎,沼本修孝,天野名都子,天野剛志,伊藤暢聡,廣明 秀一. hDvl1 PDZの結晶構造に見られた新しい相互作用. Wnt研究会 2018-2019 2019.02.02 大阪

  60. 沼本修孝, 細江雄飛, 稲葉理美, 小川修平, 森井尚之, 安部良, 織田昌幸, 伊藤暢聡. シグナル伝達分子Grb2 SH2ドメインとCD28由来ペプチド複合体の水素原子の可視化を目指した高分解能結晶構造解析. 第36回メディシナルケミストリーシンポジウム 2018.11.29

  61. 伊倉貞吉,栃尾尚哉,川嵜亮祐,松崎瑞季,成田哲博,菊本真人,楯直子,楯真一,伊藤暢聡. Pin1のWWドメインは、タウペプチドのトランス異性体の凝集化を阻害する. 第41回日本分子生物学会年会 2018.11.29 横浜市

  62. 宮下由里奈, 山本雄大, 中野祥吾, 伊藤創平, 沼本修孝, 伊倉貞吉, 伊藤暢聡, 関屋元博, 島野仁, 常磐広明. 新規代謝センサー分子CtBP2のアミノ酸配列に基づく分子設計と構造・物性評価. 第36回メディシナルケミストリーシンポジウム 2018.11.29

  63. 沼本修孝, 神谷成敏, Gert-Jan Bekker, 山上由莉, 稲葉理美, 河合富佐子, 織田昌幸, 伊藤暢聡. PET分解活性を有する酵素クチナーゼの基質結合型構造. 日本結晶学会2018年度年会 2018.11.11 東京

  64. 吉岡千咲、川崎波留、佐々木晴江、増野弘幸、河内恵美子、伊藤暢聡、影近弘之、棚谷 綾. リトコール酸をリード化合物とした新規非セコステロイド型VDRリガンドの構造活性相関. 日本レチノイド研究会第29回学術集会 2018.10.27 熊本

  65. 沼本 修孝, 赤津 ちづる, 品川 健朗, 鍔田 武志, 伊藤 暢聡. B細胞抑制性因子CD72とSm/RNPの複合体形成様式の推測. 第91回日本生化学会大会 2018.09.24 京都

  66. 千賀 明香音, 稲葉 理美, 沼本 修孝, 宮ノ入 洋平, 山上 由莉, 伊藤 暢聡, 河合 富佐子, 織田 昌幸. PET分解酵素クチナーゼのCa2+結合に伴う立体構造と熱安定性の変化. 第91回日本生化学会大会 2018.09.24 京都

  67. 細江 雄飛, 稲葉 理美, 沼本 修孝, 伊藤 暢聡, 織田 昌幸. SH2ドメインスワップダイマーが与える安定性と機能への影響評価. 第91回日本生化学会大会 2018.09.24 京都

  68. 石澤通康, Rocio Otero, 沼本 修孝, 伊倉 貞吉, 伊藤 暢聡, 常盤 広明, Antonio Maurino, 槇島 誠, 山田 幸子 . 25位アダマンチルビタミンD誘導体の構造と活性. Neo Vitamin D Workshop 2018.08.24

  69. 棚谷綾、川崎波留、佐々木晴江、増野弘幸、河内恵美子、伊藤暢聡、影近弘之. リトコール酸をリード化合物とした新規ビタミンD誘導体の構造活性相関. 第4回Neo Vitamin D Workshop学術集会 2018.08.24 東京

  70. 伊藤暢聡. 結晶構造解析とデータベースから見た蛋白質とリガンドの相互作用. 第2回バイオインタラクション研究会 2018.07.20 京都

  71. 伊倉貞吉, 米澤康滋, 伊藤暢聡. Pin1由来のタンパク質分解酵素の触媒部位の構造ダイナミクス. 第18回日本蛋白質科学会年 2018.06.27

  72. 稲葉理美, 沼本修孝, 伊藤暢聡, 織田昌幸. 免疫系シグナル伝達分子SH2と補助刺激受容体との分子間相互作用解析. 第18回日本蛋白質科学会年会 2018.06.26 新潟

  73. 石澤通康, Rocio Otero, 沼本 修孝, 伊倉 貞吉, 伊藤 暢聡, 常盤 広明, Antonio Maurino, 槇島 誠, 山田 幸子. 25-Adamantyl-1,25-dihydroxyvitamin D3誘導体の組織選択的活性. 日本ビタミン学会第70回大会 2018.06.23

  74. 宮下由里奈,山本雄大,中野祥吾,伊藤創平,沼本修孝,伊倉貞吉,伊藤暢聡,関谷元博,島野仁,常盤広明. NADH依存型脂質代謝関連蛋白質の新規分子設計に基づく分子基盤. 日本薬学会第138回年会 2018.03.27 石川

  75. 清水奏,宮下由里奈,松尾直也,中野祥吾,伊藤創平,沼本修孝,伊倉貞吉,伊藤暢聡,加来田博貴,常盤広明. hRXRαリガンドCBt-PMNのパーシャルアゴニスト活性の起源は何か?. 日本薬学会第138回年会 2018.03.27 石川

  76. 山本裕子,早乙女友規,沼本修孝,伊倉貞吉,伊藤暢聡,黒田裕. デングウイルス由来ED3におけるPro331のシストランス異性化がフォールディングとミスフォールディングに与える影響の探求. 第7回日本生物物理学会関東支部会 2018.03.14 東京

  77. 清水 奏, 宮下 由里奈, 松尾 直也, 中野 祥吾, 伊藤 創平, 沼本 修孝, 伊倉 貞吉, 伊藤 暢聡, 加来田 博貴, 常盤 広明. hRXRαリガンドCBt-PMNのパーシャルアゴニスト活性の起源は何か?. 日本薬学会年会要旨集 2018.03.01

  78. 宮下 由里奈, 山本 雄大, 中野 祥吾, 伊藤 創平, 沼本 修孝, 伊倉 貞吉, 伊藤 暢聡, 関谷 元博, 島野 仁, 常盤 広明, AMED-CREST. NADH依存型脂質代謝関連蛋白質の新規分子設計に基づく分子基盤. 日本薬学会年会要旨集 2018.03.01

  79. 清水奏,宮下由里奈,山本雄大,中野祥吾,伊藤創平,沼本修孝,伊倉貞吉,伊藤暢聡,加来田博貴,常盤広明. パーシャルアゴニストが結合したhRXRα受容体複合体に関する構造生物学および計算化学的解析. 第28回日本レチノイド研究会学術集会 2017.11.19 兵庫

  80. 川崎波留、佐々木晴江、増野弘幸、河内恵美子、伊藤暢聡、石田寛明、山本恵子、影近弘之、棚谷 綾. リトコール酸をリード化合物とした新規非セコステロイド型ビタミンD誘導体の創製. 日本レチノイド研究会第28回学術集会 2017.11.18 神戸

  81. 清水奏,宮下由里奈,山本雄大,中野祥吾,伊藤創平,沼本修孝,伊倉貞吉,伊藤暢聡,加来田博貴,島野仁,常盤広明. hRXRα/パーシャルアゴニスト複合体に対する構造生物学および理論化学の融合解析. 第35回メディシナルケミストリーシンポジウム 2017.10.26 愛知

  82. 沼本修孝, 赤津ちづる, 品川健朗, 鍔田武志, 伊藤暢聡. B細胞抑制性因子CD72の分子表面電荷分布によるリガンド結合制御機構. 第55回日本生物物理学会年会 2017.09.20 熊本

  83. 清水奏,宮下由里奈,山本雄大,中野祥吾,伊藤創平,沼本修孝,伊倉貞吉,伊藤暢聡,加来田博貴,島野仁,常盤広明. レチノイドX受容体とパーシャルアゴニストに関する相互作用解析. 第61回日本薬学会関東支部大会 2017.09.16 東京

  84. 川崎波留、 佐々木晴江、増野弘幸、河内恵美子、伊藤暢聡、石田寛明、山本恵子、平野真梨子、影近弘之、棚谷綾. リトコール酸をリード化合物とした新規非セコステロイド型VDRリガンドの構造展開. 第3回Neo Vitamin D Workshop学術集会 2017.08.25 東京

  85. 沼本修孝, 赤津ちづる, 品川健朗, 鍔田武志, 伊藤暢聡. 結晶構造によるB細胞抑制性因子CD72のリガンド結合部位の推測. 第17回日本蛋白質科学会年会 2017.06.22 仙台

  86. 棚谷綾、佐々木晴江、川崎波留、増野弘幸、河内恵美子、伊藤暢聡、石田寛明、山本恵子、平野真梨子、影近弘之. 高いビタミンD活性を有するリトコール酸誘導体の創製. 日本ビタミン学会第68回大会 2017.06.09 横浜

  87. 赤津ちづる、品川健朗、沼本修孝、劉志紅、 Aslam Mohammad、伊藤暢聡、鍔田武志. CD72はSLE関連自己抗原によるB細胞活性化を特異的に抑制する. 免疫学・病態生化学領域合同シンポジウム 2017.03.08 東京

  88. 沼本修孝, 中川太郎, 伊藤暢聡, 福森義宏, 三木邦夫. マシコヒゲムシ巨大ヘモグロビンの酸素解離中間体. 日本結晶学会2016年度年会 2016.11 茨城

  89. 赤津ちづる、品川健朗、沼本修孝、劉志紅、Aslam Mohammad、伊藤暢聡、鍔田武志. CD72は自己免疫疾患に関わる内因性TLRリガンドへの免疫応答を抑制する. 第89回日本生化学会大会 2016.09.26 宮城

  90. 赤津ちづる、品川健朗、沼本修孝、劉志紅、Aslam Mohammad、伊藤暢聡、鍔田武志. CD72は内因性TLRリガンドに対するB細胞応答を抑制し、自己免疫疾患の発症を抑制する. 第25回日本Cell Death学会学術集会 2016.09.09 東京

  91. 赤津ちづる、品川健朗、沼本修孝、劉志紅、Aslam Mohammad、伊藤暢聡、鍔田武志. B細胞に発現する抑制性分子CD72による自己免疫疾患発症抑制メカニズム. 平成28年度 日本生化学会関東支部例会 2016.06.11 栃木

  92. 伊倉貞吉, 伊藤暢聡. Pin1由来のタンパク質分解酵素の触媒機構の解析. 第16回日本蛋白質科学会年会 2016.06.08 福岡市

  93. 沼本修孝, 中川太郎, 伊藤暢聡, 福森義宏, 三木邦夫. 巨大ヘモグロビン酸素解離中間状態の解析. 第16回日本蛋白質科学会年会 2016.06 福岡

  94. 伊藤暢聡. たんぱく質の立体構造と疾患や創薬. 東京医科歯科大学難治疾患研究所市民公開講座 2015.10.23 東京

  95. 沼本修孝,中川太郎,喜田昭子,伊藤暢聡,福森義宏,三木邦夫. マシコヒゲムシ巨大ヘモグロビンのリガンド解離型構造. 日本結晶学会2015年度年会 2015.10 大阪

  96. Ikura, T., Ito, N.. Functional conversion from peptydyl-prolyl isomerase to protease by a single amino acid substitution. The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan 2015.09 金沢

  97. 沼本修孝, 稲葉理美, 森井尚之, 伊倉貞吉, 織田昌幸, 伊藤暢聡. T細胞活性化因子CD28とGadsおよびPI3-kinaseの分子認識機構. 第15回日本蛋白質科学会年会 2015.06 徳島

  98. 稲葉理美, 沼本修孝, 森井尚之, 伊倉貞吉, 安部良, 伊藤暢聡, 織田昌幸. シグナル伝達分子PI3-kinaseと補助刺激受容体ICOSとの分子間相互作用解析. 第15回日本蛋白質科学会年会 2015.06 徳島

  99. 伊倉貞吉, 栃尾尚哉, 川嵜亮佑, 楯真一, 伊藤暢聡. Pin1はタウペプチドのpT231-P232の異性化を触媒しないが、凝集を抑制する. 第15回日本蛋白質科学会年会 2015.06 徳島

  100. 伊藤 暢聡. “新しい”PDB フォーマット PDBx/mmCIF の基礎. 平成26年度日本結晶学会年会 2014.11.03 東京

  101. 沼本修孝,中川太郎,喜田昭子,伊藤暢聡,福森義宏,三木邦夫. 巨大ヘモグロビン結晶中での酸素解離に伴う構造変化. 日本結晶学会2014年度年会 2014.11 東京

  102. Nobutoshi Ito. Structure depostion at PDBj. CCP4 Crystallography School and Workshop 2014.11 つくば

  103. 品川健朗、沼本修好、鍔田武志、伊藤暢聡. B細胞共受容体CD72のC型レクチン様ドメインのX線結晶構造解析. 第52回日本生物物理学会 2014.09.25 札幌

  104. Teikichi Ikura、Nobutoshi Ito. Pin1 のプロリン異性化活性とタウタンパク質に対する凝集抑制活性との関係. 第52回日本生物物理学会年会 2014.09 札幌

  105. Kenro Shinagawa, Nobutaka Numoto, Takeshi Tsubata, Nobutoshi Ito. B 細胞共受容体 CD72 の C 型レクチン様ドメインの X 線結晶構造解析. 第52回日本生物物理学会年会 2014.09 札幌

  106. Nobutaka Numoto, Taro Nakagawa, Akiko Kita, Nobutoshi Ito, Yoshihiro Fukumori, Kunio Miki. 巨大ヘモグロビン結晶内での oxy 型から deoxy 型への移行. 第52回日本生物物理学会年会 2014.09 札幌

  107. 伊藤 暢聡. “新しい”PDB フォーマット PDBx/mmCIF の基礎. 第14回日本蛋白質科学会年会 2014.06.27 横浜

  108. 沼本 修孝、中川 太郎、喜田 昭子、伊藤 暢聡、福森 義宏、三木 邦夫. 巨大ヘモグロビン結晶内における酸素解離過程. 第14回日本蛋白質科学会年会 2014.06 横浜

  109. Manjiri Rabindoura Kurukaruni、Montasiru Elahi、Monirul M Islamu、 Nobutoshi Ito、 Nobutaka Numoto、Yutaka Kuroda. Epitope-grafted mutants provide molecular insights into sero-specifc interactions of Dengue's ED3 with its monoclonal antibody. 第14回日本蛋白質科学会年会 2014.06 横浜

  110. 伊倉 貞吉、伊藤 暢聡. タウタンパク質の脱リン酸化におけるPin1とPP2Aの協同性の分子機構. 第14回日本蛋白質科学会年会 2014.06 横浜

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その他業績 【 表示 / 非表示

  • 「自己免疫疾患全身性エリテマトーデス(SLE)の発症制御メカニズムの解明」-副作用の少ない新規治療法開発に道-,2016年10月

    The Journal of Experimental Medeicine
    記者会見実施

 

担当授業科目(学内) 【 表示 / 非表示

  • 医歯学総合概論(英語),2012年 - 現在

  • 分子構造学特論(英語),2009年 - 現在

  • 分子構造学特論,2003年 - 現在

  • 疾患生命科学概論,2003年 - 2011年

担当授業科目(学外) 【 表示 / 非表示

  • 総合生命科学,お茶の水女子大学

社会貢献活動 【 表示 / 非表示

  • 出前授業(文京区立第三中学校),文京区立第三中学校,2016年03月01日

  • 難治疾患研究所市民公開講座,難治疾患研究所市民公開講座,文京シビックセンター,2015年10月23日

  • オープンキャンパス・サイエンスカフェ,2015年07月31日