論文・総説 【 表示 / 非表示 】
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Takumi Ito, Satoshi Ohno, Yiran Wang, Saori Uematsu, Shinya Kuroda, Hideyuki Shimizu. MetDeeCINE: Deciphering Metabolic Regulation through Deep Learning and Multi-Omics 2025.03; ( DOI )
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Pan–Pharmacological Drug–Target Interaction Prediction with 3D–Informed Protein Encoding at Scale 2026.04;
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A Functional Atlas of the Tardigrade Resistome Reveals a Diverse Molecular Toolkit for Extremotolerance 2025.06; ( DOI )
書籍等出版物 【 表示 / 非表示 】
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伊東巧, 清水秀幸. 論文図表を読む作法PREMIUM. 2025.12 11章 機械学習 (ISBN : 9784758122863)
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伊東 巧, 菱沼 秀和, 清水 秀幸. 人工知能学会誌 Vol.40 No.5. 人工知能学会誌 Vol.40 No.5, 2025.09 基礎医学・生命科学研究におけるAI の活用動向の概要
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伊東 巧, 大田, 航平, 大谷, 悠喜, 清水 秀幸. 消化器病学サイエンス vol.8 no.3 2024. 先端医学社, 2024.09 AIと基礎医学の融合に向けて (ISBN : 9784865506419)
講演・口頭発表等 【 表示 / 非表示 】
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Takumi Ito, Satoshi Ohno, Yiran Wang, Shinya Kuroda, Hideyuki Shimizu. Metabolic regulatory network reconstruction using artificial intelligence and multi-omic data. 1st Asia & Pacific Bioinformatics Joint Conference 2024.10.01
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伊東 巧, 大野, 聡 Yiran Wang, 黒田真也, 清水秀幸. AIとマルチオミクスデータを用いたデータドリブンな代謝ネットワークの再構築. 第46回日本分子生物学会年会 2023.12.01
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Elucidating the Mystery of Extremotolerance of Tardigrades with AI. 2026.02.19
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小関翔馬, 加藤大貴, 伊東巧, 井口貴瑛, 秦詩雨, 安藤未来, 柴原隼斗, 加古貴大, 本井春香, 井坂凛, 池田凡子, 豊田泰斗, 高橋尚大, Chambers James, 内田和幸, 清水秀幸, 中川貴之. Comparative Oncologyアプローチに基づいた、ヒト-イヌ種横断的ゲノム比較のためのイヌがん遺伝子パネルの開発. 日本患者由来がんモデル学会 学術集会2025 2025.12.01
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南 直弥, 伊東 巧, 清水 秀幸, 吉川 泰永. 種横断エンハンサー予測AI:がん耐性・長寿動物に迫る新アプローチ. 第48回日本分子生物学会 2025.12.01
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伊東 巧, 大野 聡, 王 一然, 黒田 真也, 清水 秀幸. MetDeeCINE: 定量的代謝ネットワーク構築のためのマルチオミクス統合深層学習手法. 第48回日本分子生物学会 2025.12.01
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Takumi Ito, Satoshi Ohno, Yiran Wang, Shinya Kuroda, Hideyuki Shimizu. MetDeeCINE: A graph neural network that learns metabolic regulation with multi-omics data. Science Tokyo SPRING (MD) リトリート2025 2025.11.01
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伊東 巧, 大田 航平, 菱沼 秀和, 清水 秀幸. AIが拓く極限耐性タンパク質の潜在空間と新規分子の発見. 学術変革領域研究 (A) 天然物が織りなす化合物潜在空間が拓く生物活性分子デザイン 第2回リトリート 2025.10.01
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伊東 巧, 大野 聡, 王 一然, 黒田 真也, 清水 秀幸. MetDeeCINE: 定量的代謝ネットワーク構築のためのマルチオミクス統合AI. 2025年日本バイオインフォマティクス学会年会 2025.09.04
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増田 咲希, 大野, 聡, 古賀, 大介, 大谷, 悠喜, 大田, 航平, 伊東, 巧, 清水 秀幸. 代謝疾患の定量的な理解に向けた酵素パラメータ予測AIの開発. 第47回日本分子生物学会 2024.11.01
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小川 諒, 大野, 聡, 佐久間, 智也, 伊東 巧, 大田, 航平, 清水 秀幸. 急性骨髄性白血病の統合ネットワーク解析. 第47回日本分子生物学会 2024.11.01