経歴(学内) 【 表示 ／ 非表示 】
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2024年03月-2024年09月東京医科歯科大学 難治疾患研究所 未来生命科学研究部門 恒常性医学分野 准教授
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2024年10月-現在東京科学大学 教育研究組織 総合研究院 難治研・未来科学研究部門 恒常性医学分野 准教授
経歴(学外) 【 表示 ／ 非表示 】
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2016年12月-2021年06月Duke University School of Medicine Department of Cell Biology, Tata Lab 博士研究員
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2019年04月-2021年06月日本学術振興会 海外特別研究員
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2021年06月-2022年07月京都大学 ウイルス・再生医科学研究所（2022年4月,医生物学研究所に改称） 特定助教
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2022年08月-2024年02月京都大学 医生物学研究所 助教
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2022年08月-2024年02月京都大学 大学院生命科学研究科 助教
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2024年03月-現在東京医科歯科大学 難治疾患研究所 (2024年10月1日~ 大学統合により東京科学大学 総合研究院 難治疾患研究所) 准教授
論文・総説 【 表示 ／ 非表示 】
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Identification of distinct non-myogenic skeletal-muscle-resident mesenchymal cell populations. 2022.05; 39 (6): 110785. ( PubMed, DOI )
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Chromatin Remodeling of Colorectal Cancer Liver Metastasis is Mediated by an HGF-PU.1-DPP4 Axis. 2021.08; e2004673. ( PubMed, DOI )
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Ferroptotic stress promotes the accumulation of pro-inflammatory proximal tubular cells in maladaptive renal repair. 2021.07; 10 ( PubMed, DOI )
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Secretory Cells Dominate Airway CFTR Expression and Function in Human Airway Superficial Epithelia 2020.12; 203 (10): 1275-1289. ( PubMed, DOI )
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Persistence of a regeneration-associated, transitional alveolar epithelial cell state in pulmonary fibrosis 2020.07; 22 (8): 934-946. ( PubMed, DOI )
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Yolk-sac-derived macrophages progressively expand in the mouse kidney with age 2020.04; 9 ( PubMed, DOI )
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Katsura H, Kobayashi Y, Tata PR, Hogan BLM. IL-1 and TNFα Contribute to the Inflammatory Niche to Enhance Alveolar Regeneration. Stem Cell Reports. 2019.04; 12 (4): 657-666. ( PubMed, DOI )
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Nishie T, Kobayashi Y, Kimura K, Okuda K. Acute stimulation of a smooth muscle constrictor by oestradiol-17β via GPER1 in bovine oviducts Reproduction in Domestic Animals. 2018; 53 (2): 326-332.
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Adrenomedullin regulates the speed of oviductal fluid flow in cattle 2017.08; 84 (8): 712-718. ( PubMed, DOI )
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Local effect of lysophosphatidic acid on prostaglandin production in the bovine oviduct 2017.04; 29 (5): 1021-1028. ( PubMed, DOI )
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Altered ontogeny and transcriptomic signatures of tissue-resident pulmonary interstitial macrophages ameliorate allergic airway hyperresponsiveness Frontiers in Immunology. 2024.06; 15: 1371764 ( DOI )
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Konkimalla A*, Konishi S*, Macadlo L*, Kobayashi Y, Farino ZJ, Miyashita N, Haddad LEI, Morowitz J, Barkauskas CE, Agarwal P, Souma T, ElMallah MK, Tata A, Tata PR. *Contributed equally. Transitional cell states sculpt tissue topology during lung regeneration Cell Stem Cell. 2023.11; 30 (11): 1486-1502.e9. ( DOI )
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Sex differences in resilience to ferroptosis underlie sexual dimorphism in kidney injury and repair 2022.11; 41 (6): 111610. ( DOI )
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Coupled myovascular expansion directs cardiac growth and regeneration 2022.09; 149 (18): ( DOI )
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Multi-apical polarity of alveolar stem cells and their dynamics during lung development and regeneration 2022.09; 105114. ( DOI )
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Human distal lung maps and lineage hierarchies reveal a bipotent progenitor 2022.04; 604 (7904): 111-119. ( DOI )
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Epigenetic basis of oncogenic-Kras-mediated epithelial-cellular proliferation and plasticity 2022.02; 57 (3): 310-328.e9. ( DOI )
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Plate M, Kobayashi Y, Chambers RC, Tata PR. Lung Stem Cells in Development, Health and Disease - Epithelial stem cells at the intersection of tissue regeneration and pulmonary fibrosis European Respiratory Society Publications (ERS Monograph). 2021.04;
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Single-cell meta-analysis of SARS-CoV-2 entry genes across tissues and demographics. 2021.03;
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A versatile oblique plane microscope for large-scale and high-resolution imaging of subcellular dynamics 2020.11; 9 ( DOI )
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Human lung stem cell-based alveolospheres provide insights into SARS-CoV-2 mediated interferon responses and pneumocyte dysfunction 2020.10; 27 (6): 890-904.e8. ( DOI )
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Uezu A, Hisey E, Kobayashi Y, Gao Y, Bradshaw TW, Devlin P, Rodriguiz R, Tata PR, Soderling S. Essential role for InSyn1 in dystroglycan complex integrity and cognitive behaviors in mice. eLife. 2019.12; 8 ( PubMed, DOI )
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Tata A, Kobayashi Y, Chow RD, Tran J, Desai A, Massri AJ, McCord TJ, Gunn MD, Tata PR. Myoepithelial Cells of Submucosal Glands Can Function as Reserve Stem Cells to Regenerate Airways after Injury. Cell Stem Cell. 2018.05; 22 (5): 668-683.e6. ( PubMed, DOI )
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Kobayashi Y, Tata PR. Pulmonary Neuroendocrine Cells: Sensors and Sentinels of the Lung. Developmental Cell. 2018.05; 45 (4): 425-426. ( PubMed, DOI )
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Niche-mediated BMP/SMAD signaling regulates lung alveolar stem cell proliferation and differentiation 2018.05; 145 (9): dev163014. ( PubMed, DOI )
書籍等出版物 【 表示 ／ 非表示 】
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小林芳彦. 実験医学 - Lab Report ラボ立ち上げ期の新米PIのもとで - 理系大学院修了後の選択の一例. 羊土社, 2021.10
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小林芳彦. 実験医学 - Current topics 肺胞再生において一過性に出現する上皮細胞と、肺線維症におけるその蓄積. 羊土社, 2020.12
講演・口頭発表等 【 表示 ／ 非表示 】
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Kobayashi Y, Tata A, Tata PR. Accumulation of regeneration-specific transitional cell state in pulmonary fibrosis. Online Trial Meeting 2020, the Japansese Society of Developmental Biologists 2020.09.25
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Kobayashi Y, Tata A, Tata PR. Accumulation of regeneration-specific transitional cell state in pulmonary fibrosis. 53rd Annual Meeting of the Japansese Society of Developmental Biologists 2020.05.01
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Kobayashi Y, Tata, PR. Dynamic uni- and multi-potent progenitors contribute to airway glandular tissue regeneration.. Cold Spring Harbor Laboratory Meeting – Stem Cell Biology 2019.09.18
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小林芳彦. シングルセル解像度で明らかとなりつつある呼吸器上皮細胞の時空間的heterogeneity. 第64回日本呼吸器学会学術講演会, シンポジウム「Single cell 解析とその次へ -網羅的時空間解析-」 2024.04.08
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小林 芳彦. 肺胞組織修復過程に一過性に出現する上皮細胞状態と、肺胞線維化との関係性. 第22回日本再生医療学会総会, シンポジウム「呼吸器の幹細胞・オルガノイド研究の現状と再生医療の実現に向けて」 2023.03.23
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小林 芳彦. 肺胞組織修復過程に出現する一過性の上皮細胞状態. 日本肺サーファクタント・界面医学会第58回学術研究会, シンポジウム「肺構成細胞からみた肺環境の恒常性と再生修復」 2022.09.24
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Yoshihiko Kobayashi, Aleksandra Tata, Purushothama Rao Tata. Reservoir of tissue-resident stem cells for regeneration of airway epithelium. 第19回幹細胞シンポジウム 2022.05.28
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小林芳彦. 組織修復時に一過性に認められる上皮細胞種と、慢性呼吸器疾患におけるその蓄積. 第62回日本呼吸器学会学術講演会, シンポジウム「肺の微小環境と疾患病態」 2022.04.23