基本情報

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角田 達彦(ツノダ タツヒコ)

TSUNODA TATSUHIKO


職名

教授

出身学校 【 表示 / 非表示

  • 東京大学  理学部  物理学科  卒業

出身大学院 【 表示 / 非表示

  • 東京大学  理学系研究科  物理学専攻素粒子物理  修士課程  修了

  • 東京大学  工学系研究科  博士課程  修了

取得学位 【 表示 / 非表示

  • 博士(医学)  

  • 博士(工学)  

経歴(学内) 【 表示 / 非表示

  • 2015年07月
    -
    現在
    東京医科歯科大学 難治疾患研究所 ゲノム応用医学研究部門 医科学数理 教授
  • 2015年12月
    -
    2018年03月
    東京医科歯科大学 大学院医歯学総合研究科 生命理工学系専攻 生命理工学講座 医科学数理 教授
  • 2018年04月
    -
    現在
    東京医科歯科大学 大学院医歯学総合研究科 医歯理工学専攻 医科学数理分野 教授

経歴(学外) 【 表示 / 非表示

  • 2019年04月
    -
    現在
    東京大学 大学院 理学系研究科 生物科学専攻 医科学数理(角田研) 教授

所属学協会 【 表示 / 非表示

  • 日本癌学会

  • 日本人類遺伝学会

  • アメリカ人類遺伝学会(American Society of Human Genetics)

 

競争的資金等の研究課題 【 表示 / 非表示

  • 心房細動の治療効果を規定する分子機構の解明とリスク診断

    文部科学省/日本学術振興会 : 2018年 - 2021年

  • 次世代ヒト全ゲノム・オミクスの解析方法論の開発と応用

    文部科学省/日本学術振興会 : 2017年 - 2021年

  • マルチオミックス解析による遺伝子発現制御領域内のがん化を導く変異の予測

    文部科学省/日本学術振興会 : 2015年 - 2017年

  • 代謝アダプテーションのトランスオミクス解析の総括

    文部科学省/日本学術振興会

  • 個別化医療の開発のための統計的方法論の構築とその実践に関する総合的研究

    文部科学省/日本学術振興会

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論文・総説 【 表示 / 非表示

  • Bailey MH, Meyerson WU, Dursi LJ, Wang LB, Dong G, Liang WW, Weerasinghe A, Li S, Kelso S; MC3 Working Group; PCAWG novel somatic mutation calling methods working group, Saksena G, Ellrott K, Wendl MC, Wheeler DA, Getz G, Simpson JT, Gerstein MB, Ding L; PCAWG Consortium (including Tsunoda T).. Retrospective evaluation of whole exome and genome mutation calls in 746 cancer samples. Nat Commun. 2020.09; 11 (1): 4748. ( PubMed, DOI )

  • Ronesh Sharma, Shiu Kumar, Tatsuhiko Tsunoda, Thirumananseri Kumarevel, Alok Sharma. Single-stranded and double-stranded DNA-binding protein prediction using HMM profiles. Anal. Biochem.. 2020.09; 113954. ( PubMed, DOI )

  • Jun Hosoe, Fuyuki Miya, Hiroko Kadowaki, Toyofumi Fujiwara, Ken Suzuki, Takashi Kato, Hironori Waki, Takayoshi Sasako, Katsuya Aizu, Natsumi Yamamura, Fusako Sasaki, Makoto Kurano, Kazuo Hara, Masaki Tanaka, Hiroyuki Ishiura, Shoji Tsuji, Kenjiro Honda, Jun Yoshimura, Shinichi Morishita, Fumiko Matsuzawa, Sei-Ichi Aikawa, Keith A Boroevich, Masaomi Nangaku, Yukinori Okada, Tatsuhiko Tsunoda, Nobuhiro Shojima, Toshimasa Yamauchi, Takashi Kadowaki. Clinical usefulness of multigene screening with phenotype-driven bioinformatics analysis for the diagnosis of patients with monogenic diabetes or severe insulin resistance. Diabetes Res. Clin. Pract.. 2020.09; 108461. ( PubMed, DOI )

  • Li CH, Prokopec SD, Sun RX, Yousif F, Schmitz N; PCAWG Tumour Subtypes and Clinical Translation, Boutros PC; PCAWG Consortium (including Tsunoda T). Sex differences in oncogenic mutational processes. Nat Commun. 2020.08; 11 (1): 4330. ( PubMed, DOI )

  • Wafaa Wardah, Abdollah Dehzangi, Ghazaleh Taherzadeh, Mahmood A Rashid, M G M Khan, Tatsuhiko Tsunoda, Alok Sharma. Predicting protein-peptide binding sites with a Deep Convolutional Neural Network. J. Theor. Biol.. 2020.04; 110278. ( PubMed, DOI )

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書籍等出版物 【 表示 / 非表示

  • Tatsuhiko Tsunoda, Toshihiro Tanaka, Yusuke Nakamura (Eds.). Genome-Wide Association Studies. Springer Nature, 2019.11 (ISBN : 978-9811381768)

  • Vans E., Sharma A., Patil A., Shigemizu D., Tsunoda T. Subject-Specific-Frequency-Band for Motor Imagery EEG Signal Recognition Based on Common Spatial Spectral Pattern. In: Nayak A., Sharma A. (eds) PRICAI 2019: Trends in Artificial Intelligence. PRICAI 2019. Lecture Notes in Computer Science. Springer, 2019.08

  • Singh V, Sharma A, Chandra A, Dehzangi A, Shigemizu D, Tsunoda T. Computational Prediction of Lysine Pupylation Sites in Prokaryotic Proteins Using Position Specific Scoring Matrix into Bigram for Feature Extraction. In: Nayak A., Sharma A. (eds) PRICAI 2019: Trends in Artificial Intelligence. PRICAI 2019. Lecture Notes in Computer Science. Springer, 2019.08 (ISBN : 978-3-030-29893-7)

  • Vans E., Sharma A., Patil A., Shigemizu D., Tsunoda T. Clustering of Small-Sample Single-Cell RNA-Seq Data via Feature Clustering and Selection. In: Nayak A., Sharma A. (eds) PRICAI 2019: Trends in Artificial Intelligence. PRICAI 2019. Lecture Notes in Computer Science. Springer, 2019.08

  • Lopez Y, Kamola PJ, Sharma R, Shigemizu D, Tsunoda T, Sharma A.. Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology. Elsevier, 2018.08 Computational Pipelines and Workflows in Bioinformatics. (ISBN : 9780128114148)

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講演・口頭発表等 【 表示 / 非表示

  • 渡辺秀一、西野 穣、島田 周、石川喜也、赤星径一、小川康介、小野宏晃、伴 大輔、工藤 篤、角田達彦、田中真二、田邉 稔. Multicellular colonization modelに基づく肝癌の発生・転移形式推定の試み. 第120回日本外科学会定期学術集会 2020.08.15 Web

  • Tatsuhiko Tsunoda. Personalized Cancer Medicine with Heterogeneity and Immunological Analysis. CREST International Symposium on Big Data Application 2020.01.13 Tokyo

  • Tatsuhiko Tsunoda. Data-driven Medical Sciences with Omic Analysis. Moonshot International Symposium 2019.12.18 Tokyo

  • Tatsuhiko Tsunoda. Exploring etiologies, sub-classification, and risk prediction of diseases based on big-data analysis of clinical and whole omics data in medicine. CREST Joint International Symposium on Big Data 2019.12.17

  • Tatsuhiko Tsunoda. Exploring etiologies, sub-classification, and risk prediction of diseases based on big-data analysis of clinical and whole omics data in medicine. 2019.09.25

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Works 【 表示 / 非表示

  • DeepInsight: Package of DeepInsight methodology,コンピュータソフト,2019年08月

  • IMSIndel: An accurate intermediate-size indel detection tool incorporating de novo assembly and gapped global-local alignment with split read analysis.,コンピュータソフト,2018年04月

  • DRAGON: Matlab package of DRAGON clustering approach,コンピュータソフト,2017年09月

  • 2D-EM: Matlab package of 2D-EM clustering approach,コンピュータソフト,2017年08月

  • Arete - an analysis toolkit for network-based gene prioritisation,コンピュータソフト,2017年04月

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受賞学術賞 【 表示 / 非表示

  • Dream Challenges Certificate of Best Performance - Disease Module Identification DREAM Challenge Sub-Challenge 2,DREAM Challenge,2016年11月

  • 日本人類遺伝学会奨励賞,日本人類遺伝学会,2009年

  • The 13th Takeda Science Foundation Symposium on Bioscience on Genome Analysis and Medicine Poster Award,Takeda Science Foundation,2004年

  • 情報処理学会第48回全国大会奨励賞,情報処理学会,1994年

  • International Joint Conference on Neural Networks Student Award,International Joint Conference on Neural Networks,1993年

その他業績 【 表示 / 非表示

  • ゲノム情報の「見える化」、AIが効率的に解析 理研などが新手法開発,2019年08月

    財経新聞掲載

  • 人工知能でゲノミクスを-遺伝子など非画像データを深層学習で扱う方法-,2019年08月

    Scientific Reports

  • ゲノム情報の「見える化」、AIが効率的に解析 理研などが新手法開発,2019年08月

    live doorニュース掲載

  • ゲノム情報の「見える化」、AIが効率的に解析 理研などが新手法開発,2019年08月

    BIGLOBEニュース掲載

  • アルツハイマー病の原因遺伝子を新しく同定,2018年08月

    日経バイオテク掲載

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