基本情報

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角田 達彦(ツノダ タツヒコ)

TSUNODA TATSUHIKO


職名

教授

出身学校 【 表示 / 非表示

  • 東京大学  理学部  物理学科  卒業

出身大学院 【 表示 / 非表示

  • 東京大学  理学系研究科  物理学専攻素粒子物理  修士課程  修了

  • 東京大学  工学系研究科  博士課程  修了

取得学位 【 表示 / 非表示

  • 博士(医学)  

  • 博士(工学)  

経歴(学内) 【 表示 / 非表示

  • 2015年07月
    -
    現在
    東京医科歯科大学 難治疾患研究所 ゲノム応用医学研究部門 医科学数理 教授
  • 2015年12月
    -
    2018年03月
    東京医科歯科大学 大学院医歯学総合研究科 生命理工学系専攻 生命理工学講座 医科学数理 教授
  • 2018年04月
    -
    現在
    東京医科歯科大学 大学院医歯学総合研究科 医歯理工学専攻 医科学数理分野 教授

経歴(学外) 【 表示 / 非表示

  • 2019年04月
    -
    現在
    東京大学 大学院 理学系研究科 生物科学専攻 医科学数理(角田研) 教授

所属学協会 【 表示 / 非表示

  • 日本癌学会

  • 日本人類遺伝学会

  • アメリカ人類遺伝学会(American Society of Human Genetics)

 

競争的資金等の研究課題 【 表示 / 非表示

  • 心房細動の治療効果を規定する分子機構の解明とリスク診断

    文部科学省/日本学術振興会 : 2018年 - 2021年

  • 次世代ヒト全ゲノム・オミクスの解析方法論の開発と応用

    文部科学省/日本学術振興会 : 2017年 - 2021年

  • マルチオミックス解析による遺伝子発現制御領域内のがん化を導く変異の予測

    文部科学省/日本学術振興会 : 2015年 - 2017年

  • 個別化医療の開発のための統計的方法論の構築とその実践に関する総合的研究

    文部科学省/日本学術振興会

  • 薬剤感受性およびゲノム異常に基づいた難治性卵巣癌個別化治療戦略の確立

    文部科学省/日本学術振興会

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論文・総説 【 表示 / 非表示

  • Daichi Shigemizu, Shintaro Akiyama, Yuya Asanomi, Keith A Boroevich, Alok Sharma, Tatsuhiko Tsunoda, Takashi Sakurai, Kouichi Ozaki, Takahiro Ochiya, Shumpei Niida. A comparison of machine learning classifiers for dementia with Lewy bodies using miRNA expression data. BMC Med Genomics. 2019.10; 12 (1): 150. ( PubMed, DOI )

  • Sarvenaz Choobdar, Mehmet E Ahsen, Jake Crawford, Mattia Tomasoni, Tao Fang, David Lamparter, Junyuan Lin, Benjamin Hescott, Xiaozhe Hu, Johnathan Mercer, Ted Natoli, Rajiv Narayan, DREAM Module Identification Challenge Consortium (including Keith A. Boroevich, Piotr J. Kamola, Artem Lysenko, Tatsuhiko Tsunoda), Aravind Subramanian, Jitao D Zhang, Gustavo Stolovitzky, Zoltán Kutalik, Kasper Lage, Donna K Slonim, Julio Saez-Rodriguez, Lenore J Cowen, Sven Bergmann, Daniel Marbach. Assessment of network module identification across complex diseases. Nat. Methods. 2019.09; 16 (9): 843-852. ( PubMed, DOI )

  • Alok Sharma, Edwin Vans, Daichi Shigemizu, Keith A Boroevich, Tatsuhiko Tsunoda. DeepInsight: A methodology to transform a non-image data to an image for convolution neural network architecture. Sci Rep. 2019.08; 9 (1): 11399. ( PubMed, DOI )

  • Kohji Kato, Fuyuki Miya, Nanako Hamada, Yutaka Negishi, Yoko Narumi-Kishimoto, Hiroshi Ozawa, Hidenori Ito, Ikumi Hori, Ayako Hattori, Nobuhiko Okamoto, Mitsuhiro Kato, Tatsuhiko Tsunoda, Yonehiro Kanemura, Kenjiro Kosaki, Yoshiyuki Takahashi, Koh-Ichi Nagata, Shinji Saitoh. de novo gain-of-function mutation in a patient with a novel megalencephaly syndrome. J. Med. Genet.. 2019.06; 56 (6): 388-395. ( PubMed, DOI )

  • Michael P Menden, Dennis Wang, Mike J Mason, Bence Szalai, Krishna C Bulusu, Yuanfang Guan, Thomas Yu, Jaewoo Kang, Minji Jeon, Russ Wolfinger, Tin Nguyen, Mikhail Zaslavskiy, Astra-Zeneca-Sanger Drug Combination DREAM Consortium (including Keith A Boroevich, Artem Lysenko, Tatsuhiko Tsunoda) , In Sock Jang, Zara Ghazoui, Mehmet Eren Ahsen, Robert Vogel, Elias Chaibub Neto, Thea Norman, Eric K Y Tang, Mathew J Garnett, Giovanni Y Di Veroli, Stephen Fawell, Gustavo Stolovitzky, Justin Guinney, Jonathan R Dry, Julio Saez-Rodriguez. Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen. Nat Commun. 2019.06; 10 (1): 2674. ( PubMed, DOI )

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書籍等出版物 【 表示 / 非表示

  • Tatsuhiko Tsunoda, Toshihiro Tanaka, Yusuke Nakamura (Eds.). Genome-Wide Association Studies. Springer Nature, 2019.11 (ISBN : 978-9811381768)

  • Lopez Y, Kamola PJ, Sharma R, Shigemizu D, Tsunoda T, Sharma A.. Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology. Elsevier, 2018.08 Computational Pipelines and Workflows in Bioinformatics. (ISBN : 9780128114148)

  • 松原 謙一, 榊 佳之 監修(角田 達彦 他 著). ゲノム機能 発現プロファイルとトランスクリプトーム. 中山書店, 2000.09 (ISBN : 978-4521610214)

  • 中村 祐輔 編集(角田 達彦 他 著). SNP 遺伝子多型の戦略. 中山書店, 2000.05 (ISBN : 978-4521610115)

  • 長尾 眞, 佐藤 理史, 黒橋 禎夫, 角田 達彦. 自然言語処理(岩波講座 ソフトウェア科学第15巻). 岩波書店, 1996.04 (ISBN : 978-4000103558)

講演・口頭発表等 【 表示 / 非表示

  • Tatsuhiko Tsunoda. Medical Big Data Analysis for Precision Medicine. CREST Joint International Symposium for Big Data 2019.03.12 Kyoto, Japan

  • Tatsuhiko Tsunoda. Cancer heterogeneity and immunology for precision medicine. CREST International Symposium on Big Data Application 2019.01.15 Tokyo, Japan

  • 角田 達彦. ゲノム医科学の進展とプレシジョン医療の推進. 東北メディカルメガバンク第16回ゲノム・オミックス連携推進セミナー 2018.12.04

  • Tatsuhiko Tsunoda. Trans-omic and Trans-species Analysis Drives Precision Medicine. The 41st Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2018.11.30 Yokohama, Japan

  • Tatsuhiko Tsunoda. Trans-omic Analysis Strategy for Precision Medicine. The 2nd International Symposium for Trans-Omics 2018.11.14

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Works 【 表示 / 非表示

  • DeepInsight: Package of DeepInsight methodology,コンピュータソフト,2019年08月

  • IMSIndel: An accurate intermediate-size indel detection tool incorporating de novo assembly and gapped global-local alignment with split read analysis.,コンピュータソフト,2018年04月

  • DRAGON: Matlab package of DRAGON clustering approach,コンピュータソフト,2017年09月

  • 2D-EM: Matlab package of 2D-EM clustering approach,コンピュータソフト,2017年08月

  • Arete - an analysis toolkit for network-based gene prioritisation,コンピュータソフト,2017年04月

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受賞学術賞 【 表示 / 非表示

  • Dream Challenges Certificate of Best Performance - Disease Module Identification DREAM Challenge Sub-Challenge 2,DREAM Challenge,2016年11月

  • 日本人類遺伝学会奨励賞,日本人類遺伝学会,2009年

  • The 13th Takeda Science Foundation Symposium on Bioscience on Genome Analysis and Medicine Poster Award,Takeda Science Foundation,2004年

  • 情報処理学会第48回全国大会奨励賞,情報処理学会,1994年

  • International Joint Conference on Neural Networks Student Award,International Joint Conference on Neural Networks,1993年

その他業績 【 表示 / 非表示

  • ゲノム情報の「見える化」、AIが効率的に解析 理研などが新手法開発,2019年08月

    財経新聞掲載

  • 人工知能でゲノミクスを-遺伝子など非画像データを深層学習で扱う方法-,2019年08月

    Scientific Reports

  • ゲノム情報の「見える化」、AIが効率的に解析 理研などが新手法開発,2019年08月

    live doorニュース掲載

  • ゲノム情報の「見える化」、AIが効率的に解析 理研などが新手法開発,2019年08月

    BIGLOBEニュース掲載

  • アルツハイマー病の原因遺伝子を新しく同定-マウスとヒトのデータを統合した新たな解析手法の開発-,2018年08月

    Human Genetics

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