基本情報

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角田 達彦(ツノダ タツヒコ)

TSUNODA TATSUHIKO


職名

教授

出身学校 【 表示 / 非表示

  • 東京大学  理学部  物理学科  卒業

出身大学院 【 表示 / 非表示

  • 東京大学  理学系研究科  物理学専攻素粒子物理  修士課程  修了

  • 東京大学  工学系研究科  博士課程  修了

取得学位 【 表示 / 非表示

  • 博士(医学)  

  • 博士(工学)  

経歴(学内) 【 表示 / 非表示

  • 2015年07月
    -
    現在
    東京医科歯科大学 難治疾患研究所 ゲノム応用医学研究部門 医科学数理 教授
  • 2015年12月
    -
    2018年03月
    東京医科歯科大学 大学院医歯学総合研究科 生命理工学系専攻 生命理工学講座 医科学数理 教授
  • 2018年04月
    -
    現在
    東京医科歯科大学 大学院医歯学総合研究科 医歯理工学専攻 医科学数理分野 教授

経歴(学外) 【 表示 / 非表示

  • 2019年04月
    -
    現在
    東京大学 大学院 理学系研究科 生物科学専攻 医科学数理(角田研) 教授

所属学協会 【 表示 / 非表示

  • 日本癌学会

  • 日本人類遺伝学会

  • アメリカ人類遺伝学会(American Society of Human Genetics)

 

競争的資金等の研究課題 【 表示 / 非表示

  • 心房細動の治療効果を規定する分子機構の解明とリスク診断

    文部科学省/日本学術振興会 : 2018年 - 2021年

  • 次世代ヒト全ゲノム・オミクスの解析方法論の開発と応用

    文部科学省/日本学術振興会 : 2017年 - 2021年

  • マルチオミックス解析による遺伝子発現制御領域内のがん化を導く変異の予測

    文部科学省/日本学術振興会 : 2015年 - 2017年

  • 薬剤感受性およびゲノム異常に基づいた難治性卵巣癌個別化治療戦略の確立

    文部科学省/日本学術振興会

  • 代謝アダプテーションのトランスオミクス解析の総括

    文部科学省/日本学術振興会

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論文・総説 【 表示 / 非表示

  • Shiu Kumar, Alok Sharma, Tatsuhiko Tsunoda. Brain wave classification using long short-term memory network based OPTICAL predictor. Sci Rep. 2019.06; 9 (1): 9153. ( PubMed, DOI )

  • Michael P Menden, Dennis Wang, Mike J Mason, Bence Szalai, Krishna C Bulusu, Yuanfang Guan, Thomas Yu, Jaewoo Kang, Minji Jeon, Russ Wolfinger, Tin Nguyen, Mikhail Zaslavskiy, Astra-Zeneca-Sanger Drug Combination DREAM Consortium (including Keith A Boroevich, Artem Lysenko, Tatsuhiko Tsunoda) , In Sock Jang, Zara Ghazoui, Mehmet Eren Ahsen, Robert Vogel, Elias Chaibub Neto, Thea Norman, Eric K Y Tang, Mathew J Garnett, Giovanni Y Di Veroli, Stephen Fawell, Gustavo Stolovitzky, Justin Guinney, Jonathan R Dry, Julio Saez-Rodriguez. Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen. Nat Commun. 2019.06; 10 (1): 2674. ( PubMed, DOI )

  • Abel Avitesh Chandra, Alok Sharma, Abdollah Dehzangi, Tatushiko Tsunoda. EvolStruct-Phogly: incorporating structural properties and evolutionary information from profile bigrams for the phosphoglycerylation prediction. BMC Genomics. 2019.04; 19 (Suppl 9): 984. ( PubMed, DOI )

  • Alok Sharma, Artem Lysenko, Yosvany López, Abdollah Dehzangi, Ronesh Sharma, Hamendra Reddy, Abdul Sattar, Tatsuhiko Tsunoda. HseSUMO: Sumoylation site prediction using half-sphere exposures of amino acids residues. BMC Genomics. 2019.04; 19 (Suppl 9): 982. ( PubMed, DOI )

  • Ronesh Sharma, Alok Sharma, Ashwini Patil, Tatsuhiko Tsunoda. Discovering MoRFs by trisecting intrinsically disordered protein sequence into terminals and middle regions. BMC Bioinformatics. 2019.02; 19 (Suppl 13): 378. ( PubMed, DOI )

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書籍等出版物 【 表示 / 非表示

  • Lopez Y, Kamola PJ, Sharma R, Shigemizu D, Tsunoda T, Sharma A.. Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology. Elsevier, 2018.08 Computational Pipelines and Workflows in Bioinformatics. (ISBN : 9780128114148)

  • 松原 謙一, 榊 佳之 監修(角田 達彦 他 著). ゲノム機能 発現プロファイルとトランスクリプトーム. 中山書店, 2000.09 (ISBN : 978-4521610214)

  • 中村 祐輔 編集(角田 達彦 他 著). SNP 遺伝子多型の戦略. 中山書店, 2000.05 (ISBN : 978-4521610115)

  • 長尾 眞, 佐藤 理史, 黒橋 禎夫, 角田 達彦. 自然言語処理(岩波講座 ソフトウェア科学第15巻). 岩波書店, 1996.04 (ISBN : 978-4000103558)

講演・口頭発表等 【 表示 / 非表示

  • Tatsuhiko Tsunoda. Medical Big Data Analysis for Precision Medicine. CREST Joint International Symposium for Big Data 2019.03.12 Kyoto, Japan

  • Tatsuhiko Tsunoda. Cancer heterogeneity and immunology for precision medicine. CREST International Symposium on Big Data Application 2019.01.15 Tokyo, Japan

  • 角田 達彦. ゲノム医科学の進展とプレシジョン医療の推進. 東北メディカルメガバンク第16回ゲノム・オミックス連携推進セミナー 2018.12.04

  • Tatsuhiko Tsunoda. Trans-omic and Trans-species Analysis Drives Precision Medicine. The 41st Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2018.11.30 Yokohama, Japan

  • Tatsuhiko Tsunoda. Trans-omic Analysis Strategy for Precision Medicine. The 2nd International Symposium for Trans-Omics 2018.11.14

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Works 【 表示 / 非表示

  • IMSIndel: An accurate intermediate-size indel detection tool incorporating de novo assembly and gapped global-local alignment with split read analysis.,コンピュータソフト,2018年04月

  • DRAGON: Matlab package of DRAGON clustering approach,コンピュータソフト,2017年09月

  • 2D-EM: Matlab package of 2D-EM clustering approach,コンピュータソフト,2017年08月

  • Arete - an analysis toolkit for network-based gene prioritisation,コンピュータソフト,2017年04月

  • SIML: Matlab package of SIML clustering approach,コンピュータソフト,2016年08月

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受賞学術賞 【 表示 / 非表示

  • Dream Challenges Certificate of Best Performance - Disease Module Identification DREAM Challenge Sub-Challenge 2,DREAM Challenge,2016年11月

  • 日本人類遺伝学会奨励賞,日本人類遺伝学会,2009年

  • The 13th Takeda Science Foundation Symposium on Bioscience on Genome Analysis and Medicine Poster Award,Takeda Science Foundation,2004年

  • 情報処理学会第48回全国大会奨励賞,情報処理学会,1994年

  • International Joint Conference on Neural Networks Student Award,International Joint Conference on Neural Networks,1993年

その他業績 【 表示 / 非表示

  • アルツハイマー病の原因遺伝子を新しく同定-マウスとヒトのデータを統合した新たな解析手法の開発-,2018年08月

    Human Genetics

  • アルツハイマー病に新遺伝子 統合解析手法を用いて同定,2018年08月

    薬事日報掲載

  • アルツハイマー遺伝子 理研など新たに特定,2018年08月

    日刊工業新聞掲載

  • アルツハイマー病の原因遺伝子2つを新たに同定,2018年08月

    医療ニュース QLifePro掲載

  • アルツハイマー病の原因遺伝子を新しく同定,2018年08月

    日経バイオテク掲載

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